140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4301 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.3 
 
 		 209 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.3 
 
 		 209 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.3 
 
 		 209 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.04 
 
 		 209 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.08 
 
 		 209 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.08 
 
 		 209 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  79.43 
 
 		 209 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  79.43 
 
 		 209 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  79.43 
 
 		 209 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  78.47 
 
 		 209 aa  330  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.83 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.78 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  32.86 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  28.04 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  34.67 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  31.05 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  28.8 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  28.8 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  30.23 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.52 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  31.36 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  30.1 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  29.15 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  33.33 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  34.76 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  24.4 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  30.67 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  27.41 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  35.51 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  27.19 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  27.41 
 
 		 267 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  35.78 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 		 306 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.44 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.37 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 		 299 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  27.73 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  28.78 
 
 		 366 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  28.32 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  29.39 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  28.4 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.6 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 305 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  25.23 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 320 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  25.23 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  28.5 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  30.43 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  26.61 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  22.4 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  28.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 		 227 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30.32 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.04 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  25.52 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>