213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0979 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.55 
 
 
213 aa  243  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.57 
 
 
210 aa  194  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.02 
 
 
212 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.6 
 
 
211 aa  185  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
214 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  33.03 
 
 
221 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  33.03 
 
 
221 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  31.34 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  31.67 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  29.36 
 
 
218 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  28.83 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.29 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  26.85 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  25.35 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  31.19 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.94 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.79 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  28.04 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  23.7 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  27.68 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.02 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  29.72 
 
 
374 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  28.96 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  25.49 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  25.36 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  26.43 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  33.33 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  27.01 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  24.71 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
301 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.32 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.57 
 
 
320 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.97 
 
 
320 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.39 
 
 
323 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.94 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
218 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.39 
 
 
323 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
203 aa  54.7  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
326 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
479 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.7 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  26.7 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  26.7 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.95 
 
 
320 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.09 
 
 
320 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.28 
 
 
477 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.42 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.28 
 
 
477 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  26.99 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  23.63 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  25.16 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.16 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
378 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273569  normal  0.188278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  21.9 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  23.35 
 
 
357 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.36 
 
 
477 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.95 
 
 
324 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  27.49 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
358 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  26.54 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.28 
 
 
477 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  23.71 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  23.6 
 
 
339 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.57 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.68 
 
 
327 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  23.5 
 
 
293 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.28 
 
 
477 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.71 
 
 
320 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  22.58 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
382 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
270 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.63 
 
 
476 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>