104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0839 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
212 aa  430  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  54.72 
 
 
212 aa  254  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  54.72 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  54.25 
 
 
212 aa  251  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  51.42 
 
 
212 aa  229  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  53.52 
 
 
218 aa  224  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  51.89 
 
 
217 aa  222  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.24 
 
 
194 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  55.41 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  40.48 
 
 
210 aa  159  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  38.03 
 
 
210 aa  145  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.73 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  33.49 
 
 
205 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.22 
 
 
69 aa  89.4  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  30.1 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  29.59 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  30.1 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  29.59 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  29.44 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  28.93 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  29.59 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  29.59 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  25.98 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  29.59 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  26.04 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  24.64 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
270 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  25.85 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  24.37 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.35 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  25.13 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  25.13 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
211 aa  52  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  21.72 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  21.72 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  21.72 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  26.89 
 
 
339 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  25.21 
 
 
339 aa  48.9  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  25.97 
 
 
295 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
334 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  24.88 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  23.65 
 
 
211 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  25.49 
 
 
218 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  25.48 
 
 
213 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
309 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  24.65 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 
272 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.79 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  23.65 
 
 
285 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  25.45 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  24.19 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  24.42 
 
 
326 aa  45.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  23.78 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.28 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
213 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  24.14 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 
291 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  24.14 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.68 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  24.14 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  24.14 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.94 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  24.14 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  26.54 
 
 
300 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  23.33 
 
 
291 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  23.38 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  23.26 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  26.22 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  26.22 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  24.64 
 
 
327 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  22.64 
 
 
287 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
337 aa  42.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  22.84 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  25 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  22.11 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
319 aa  42  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.28 
 
 
333 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  23.65 
 
 
276 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
209 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.12 
 
 
219 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  25.51 
 
 
257 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.27 
 
 
308 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
325 aa  41.6  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
287 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>