66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1875 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.52 
 
 		 212 aa  224  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  51.39 
 
 		 217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  46.98 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  47.44 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  46.51 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  46.76 
 
 		 212 aa  194  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  37.61 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.8 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  44.74 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  32.57 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  31.31 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.03 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  27.5 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  27.59 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  26.06 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  26.06 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  27.27 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  27.27 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  26.06 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  22.17 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  26.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  26.29 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  27.64 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  30.56 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  24.41 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  24.41 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  24.41 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  24.38 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  26.29 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  24.35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  25.32 
 
 		 295 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 		 313 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  24.02 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  23.44 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45185  predicted protein  23.61 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.19 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  24.26 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  23.12 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  23.27 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 		 330 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  25.47 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  31.43 
 
 		 318 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  23.78 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.07 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  23.75 
 
 		 290 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 325 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  22.1 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 		 312 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 211 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 		 222 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  23.23 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 332 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>