More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1895 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  100 
 
 		 214 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  56.74 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.81 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  32.35 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  30.62 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.96 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  30.77 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  31.37 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.48 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  31.93 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  31.93 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  31.93 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  28.04 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  31.93 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  31.93 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  31.33 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  31.76 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  33.14 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00190  hypothetical protein  27.43 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  27.03 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  27.96 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  27.72 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  26.17 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  31.98 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  27.57 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  28.32 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.8 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  27.1 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  28.75 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  23.18 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  29.03 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  24.64 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  27.45 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  28.91 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  28.78 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.92 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  25.6 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  26.96 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  23.18 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  26.96 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  24.76 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.35 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  27.36 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  23.74 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  27.8 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  27.49 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  27.27 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  25.81 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  27.41 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  26.47 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  26.47 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  26.47 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  25.94 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44077  predicted protein  27.8 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  29.09 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  29.14 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  23.64 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  27.23 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  26.17 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  26.99 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  30.49 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  27.39 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  27.27 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  29.14 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>