226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4220 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 210 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  46.89 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2134  hypothetical protein  49 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.54 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  35.76 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.34 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  31.74 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  52.78 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.96 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  45.16 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.96 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  47.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.1 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  32.99 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.95 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  44.55 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  33.15 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  31.16 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  32.48 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  38.66 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2892  putative NADH-flavin reductase  33.04 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  30.7 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  30.49 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  36.62 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  30.56 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.65 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  32.29 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  29.66 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  32.29 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  35.53 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  31.25 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.22 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  42.22 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  31.25 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  31.25 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0768  putative NADH-flavin reductase  36.11 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  49.23 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  44.12 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  52.05 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  41.11 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  41.11 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  39.78 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  41.11 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  30.28 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  39.33 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.71 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.73 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.86 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  46.03 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  43.66 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  28.95 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 		 309 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  46.38 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  43.94 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  30.59 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  42.47 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.84 
 
 		 346 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 298 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.66 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  33.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.48 
 
 		 324 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  44.16 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.07 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.07 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  33.33 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.07 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>