90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4051 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  493  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.77 
 
 
239 aa  349  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.77 
 
 
243 aa  337  8e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.04 
 
 
229 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3439  hypothetical protein  73.6 
 
 
202 aa  296  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.89 
 
 
231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  25.88 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  31.28 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  27.85 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
211 aa  58.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  27.88 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.69 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  23.56 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  23.39 
 
 
206 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.48 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  35.11 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  21.64 
 
 
206 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  22.81 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  23.61 
 
 
211 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  22.22 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
210 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  21.64 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.71 
 
 
330 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  23.7 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  21.64 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  23.61 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  24.42 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  21.64 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  23.15 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  36.11 
 
 
214 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  23.15 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  23.15 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  24.26 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.65 
 
 
876 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
347 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
316 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  36.36 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  29.71 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
336 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  27.39 
 
 
289 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  24.27 
 
 
207 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  27.62 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  34.15 
 
 
297 aa  45.4  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  37.5 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  32.61 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.65 
 
 
355 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
326 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  29.41 
 
 
486 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  32.18 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  28 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  41.67 
 
 
341 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  36.11 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  33.77 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45041  predicted protein  32.29 
 
 
333 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  30.69 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  34.91 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.23 
 
 
330 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  29.59 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  40.28 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  31.91 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
334 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  35.71 
 
 
325 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  35.06 
 
 
320 aa  43.1  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  37.8 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  34.29 
 
 
323 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.49 
 
 
334 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
326 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  34.29 
 
 
323 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  28.26 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  31.94 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  33.62 
 
 
854 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  32.28 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  45.45 
 
 
357 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  47.06 
 
 
346 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  24.43 
 
 
366 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  26.91 
 
 
213 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  26.26 
 
 
211 aa  42  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
332 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>