203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3811 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
336 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.77 
 
 
326 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.46 
 
 
326 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.98 
 
 
327 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.38 
 
 
325 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.38 
 
 
325 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.38 
 
 
325 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  62.14 
 
 
332 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.81 
 
 
333 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  62.14 
 
 
345 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  62.14 
 
 
345 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  62.14 
 
 
345 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.81 
 
 
345 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.1 
 
 
340 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.81 
 
 
345 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.11 
 
 
318 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.47 
 
 
318 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.46 
 
 
340 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  59.74 
 
 
318 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  54.05 
 
 
370 aa  342  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.11 
 
 
340 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.73 
 
 
352 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.27 
 
 
337 aa  311  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.85 
 
 
338 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.07 
 
 
326 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 
316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 
324 aa  242  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.23 
 
 
162 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.51 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
287 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
321 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.04 
 
 
122 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
312 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
329 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
329 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
329 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
318 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
321 aa  99.4  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
309 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.36 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
318 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
306 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  28.46 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.11 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
300 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  21.57 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
307 aa  59.3  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.35 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3118  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.22 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.94 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
276 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.26 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  29.29 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
326 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 
352 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  34.62 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 
333 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>