149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2358 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 231 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.44 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  63.89 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.62 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.91 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3439  hypothetical protein  59.09 
 
 		 202 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215773  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  29.26 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  26.34 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.91 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  29.78 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  32.54 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  28.32 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  28.17 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  28.95 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  25.23 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.1 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  33.67 
 
 		 300 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.95 
 
 		 330 aa  52  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.67 
 
 		 333 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  29.05 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.46 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  27.98 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  38.71 
 
 		 321 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  25.49 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  31.91 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 		 334 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  35.96 
 
 		 854 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 		 314 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  31.52 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 320 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.14 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.75 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.03 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  28.38 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.48 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  28.38 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 347 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  41.77 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  33.77 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  36.84 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  36.49 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  29.79 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 		 530 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  46.48 
 
 		 282 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.77 
 
 		 876 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  34.94 
 
 		 297 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.63 
 
 		 347 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  55.88 
 
 		 346 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.87 
 
 		 324 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 		 325 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  33.96 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  22.77 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.69 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  31.06 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  28.77 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  23.3 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  28.92 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  37.14 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  22.18 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.48 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.24 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  33.12 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  22.99 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>