221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1353 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  100 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  45.71 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  38.86 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  39.09 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  38.86 
 
 		 212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  34.45 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  33.98 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 231 aa  97.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  35.05 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  35.85 
 
 		 231 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  37.74 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  36.18 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  30.94 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.88 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.73 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  30.19 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  22.38 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  21.9 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.09 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  21.89 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  22.38 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  22.38 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  22.38 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  27.57 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  33.64 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  28.9 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  30.56 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  30.59 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.91 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  29.38 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  26.79 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  28.5 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  32.71 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  28.64 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  34.47 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  25 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  24.29 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  23.81 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  28.77 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  23.33 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  28.08 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  35.1 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  27.31 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  31.02 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  24.53 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.02 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  31.02 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  31.02 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  28.37 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  30.73 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  34.56 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  29.56 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  30.56 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>