More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4085 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 211 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  48.82 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  48.74 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  42.92 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  43.6 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  45.5 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  44.16 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  42 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  39.81 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.71 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  31.75 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.37 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  34.25 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.88 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  31.42 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.75 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  28.02 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  32.73 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  28.1 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.72 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  31.42 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  31.02 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  25.29 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  30.7 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  30.52 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  28.83 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  24.71 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  24.71 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  27.47 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  24.12 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  28.76 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  24.71 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  27.47 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  24.71 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  28.76 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  24.65 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  28.25 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  27.91 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  27.47 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  27.07 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  35.65 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  37.85 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  29.96 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.81 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  30.37 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.31 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  32.56 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.92 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  26.89 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  28.3 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.9 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  32.3 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  34.38 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  25.79 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  32.53 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  25.94 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  28.25 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  29.86 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  25.94 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  25.94 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  27.15 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  29.82 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  32.83 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  25.94 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  30.63 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  29.07 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  34.06 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>