263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4516 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  100 
 
 
231 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.39 
 
 
231 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.26 
 
 
231 aa  248  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.96 
 
 
231 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  51.74 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.92 
 
 
211 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  43.46 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  37.26 
 
 
211 aa  121  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  39.02 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  41.31 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  39.72 
 
 
211 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  34.6 
 
 
212 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.86 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  32.56 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  35.85 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.7 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  39.77 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  24.65 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
211 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  24.77 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  24.3 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  24.3 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  24.3 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  24.3 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  33.49 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  35.48 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  32.37 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.52 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.53 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.57 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  25.61 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  25 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  28.37 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  24.07 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.53 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  25 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  25 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  25 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  25 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  25 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  25 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  24.39 
 
 
206 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
291 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  31.65 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  30.36 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
296 aa  62  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  27.73 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  23.81 
 
 
221 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  23.35 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  31.21 
 
 
211 aa  62  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  23.87 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  30 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  31.21 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  23.25 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
306 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  23.42 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.86 
 
 
279 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  22.71 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  23.68 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  28.04 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  30.62 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  22.97 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  28.51 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  34.32 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  23.87 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  23.87 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  29.55 
 
 
207 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  24.24 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  24.32 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  22.97 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  22.97 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  38.6 
 
 
854 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  23.42 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  22.97 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  23.81 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  22.52 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
227 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>