More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1230 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  47.87 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  46.48 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  50 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.74 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  40.48 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  38.86 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  35.92 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  37.26 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  39.72 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  31.9 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  31.43 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.61 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  31.43 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  31.43 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  31.43 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  30.95 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  31.43 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  31.43 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  29.58 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  30.95 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 		 231 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  28.29 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  27.8 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.5 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  27.8 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  27.8 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  27.8 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  27.72 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.83 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  37.13 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  30.62 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.05 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  29.67 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.07 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  28.25 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  32.26 
 
 		 282 aa  85.5  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  32.18 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  34.8 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  35.92 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  34.5 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  30.67 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  27.23 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  29.47 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.85 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  31.98 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  31.07 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  30.66 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  31.5 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  30.24 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  32.64 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1088  hypothetical protein  32.23 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  33.18 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  28.29 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  32.2 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  31.9 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  28.37 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  38.4 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  33.82 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  28.97 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  29.9 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  33.01 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>