More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12084 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  100 
 
 
854 aa  1686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11896  hypothetical protein  31.77 
 
 
699 aa  196  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.687176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  31.14 
 
 
791 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  35.71 
 
 
537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  27.41 
 
 
837 aa  128  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.2 
 
 
884 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.2 
 
 
873 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.78 
 
 
867 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  28.87 
 
 
890 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  26.51 
 
 
708 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  27.18 
 
 
725 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.23 
 
 
889 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.09 
 
 
811 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.72 
 
 
868 aa  109  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.86 
 
 
902 aa  110  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 
892 aa  108  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 
842 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.77 
 
 
840 aa  107  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  26.69 
 
 
866 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  31.07 
 
 
854 aa  105  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  25.83 
 
 
868 aa  104  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.78 
 
 
891 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  25.5 
 
 
868 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  25.74 
 
 
869 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.87 
 
 
887 aa  103  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  25.08 
 
 
868 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  24.92 
 
 
868 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.5 
 
 
821 aa  101  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  25.08 
 
 
868 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  29.7 
 
 
868 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  25.17 
 
 
868 aa  101  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
865 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  25.08 
 
 
869 aa  100  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  27.78 
 
 
788 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.44 
 
 
869 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  26.4 
 
 
956 aa  99.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  35.78 
 
 
870 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  38.25 
 
 
558 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  32.76 
 
 
826 aa  99.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  33.23 
 
 
886 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.11 
 
 
852 aa  98.6  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.58 
 
 
950 aa  97.8  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  29.43 
 
 
907 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0515  hypothetical protein  35.53 
 
 
546 aa  96.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  31.72 
 
 
842 aa  95.9  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  25.5 
 
 
868 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.21 
 
 
971 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.21 
 
 
971 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  31.72 
 
 
842 aa  95.9  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  31.75 
 
 
560 aa  95.9  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  31.73 
 
 
871 aa  95.1  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  31.06 
 
 
906 aa  95.1  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  29.24 
 
 
891 aa  94.7  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  32.11 
 
 
963 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  29.43 
 
 
885 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  28.36 
 
 
874 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  29.43 
 
 
885 aa  92  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.72 
 
 
887 aa  91.3  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.33 
 
 
903 aa  90.5  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  28.34 
 
 
871 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.17 
 
 
975 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  47.17 
 
 
583 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  47.17 
 
 
586 aa  86.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.53 
 
 
959 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
294 aa  85.9  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  30.77 
 
 
609 aa  84  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  32.65 
 
 
835 aa  82  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.54 
 
 
592 aa  82  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  30.23 
 
 
610 aa  81.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  38.62 
 
 
825 aa  81.3  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  42.57 
 
 
758 aa  80.9  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  36.07 
 
 
769 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0682  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  26.21 
 
 
873 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  43.56 
 
 
758 aa  79.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  46.25 
 
 
582 aa  79  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  47.06 
 
 
434 aa  79  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.26 
 
 
835 aa  79  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  31.13 
 
 
602 aa  79  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  38.4 
 
 
758 aa  78.2  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  40.32 
 
 
765 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
349 aa  77.4  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
330 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  42.57 
 
 
583 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.6 
 
 
386 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  26.94 
 
 
594 aa  76.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  29.57 
 
 
622 aa  75.1  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  38.71 
 
 
971 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
347 aa  74.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  39.22 
 
 
797 aa  72.8  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  38.61 
 
 
585 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  38.26 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
294 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  38 
 
 
782 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  39.52 
 
 
806 aa  71.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.83 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  27.25 
 
 
1240 aa  71.2  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.55 
 
 
725 aa  71.2  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  37.25 
 
 
584 aa  71.2  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>