More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2689 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 871 aa  1729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.93 
 
 		 902 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 892 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.32 
 
 		 891 aa  360  7e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  29.97 
 
 		 871 aa  273  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.48 
 
 		 887 aa  211  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 		 865 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  40.69 
 
 		 760 aa  194  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 		 781 aa  194  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  38.14 
 
 		 788 aa  194  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  36.39 
 
 		 764 aa  193  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  51.05 
 
 		 312 aa  191  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  36.44 
 
 		 866 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  33.79 
 
 		 868 aa  188  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.01 
 
 		 950 aa  188  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 		 870 aa  188  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  37.3 
 
 		 891 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  25.58 
 
 		 1097 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 758 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 868 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  32.69 
 
 		 868 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  38.23 
 
 		 824 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  38.91 
 
 		 780 aa  185  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.76 
 
 		 873 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  32.04 
 
 		 868 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  32.6 
 
 		 868 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  33.64 
 
 		 758 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.95 
 
 		 869 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  41.14 
 
 		 907 aa  182  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  36.51 
 
 		 754 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  33.94 
 
 		 758 aa  181  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  36.53 
 
 		 785 aa  181  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  31.49 
 
 		 869 aa  180  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  42.58 
 
 		 971 aa  180  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  27.55 
 
 		 854 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 757 aa  180  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 799 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  32.42 
 
 		 868 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  32.42 
 
 		 868 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.96 
 
 		 302 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  37.89 
 
 		 906 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  36.3 
 
 		 890 aa  178  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  32.14 
 
 		 869 aa  178  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  35.11 
 
 		 761 aa  178  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.94 
 
 		 769 aa  177  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 779 aa  177  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  31.87 
 
 		 868 aa  177  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  35.03 
 
 		 785 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  35.01 
 
 		 885 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  34.25 
 
 		 809 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  33.03 
 
 		 825 aa  175  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  35.34 
 
 		 885 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  32.94 
 
 		 758 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  34.86 
 
 		 810 aa  174  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  36.2 
 
 		 382 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  33.65 
 
 		 761 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  31.19 
 
 		 758 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  34.59 
 
 		 762 aa  172  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.9 
 
 		 975 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  32.31 
 
 		 758 aa  173  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.26 
 
 		 903 aa  171  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.66 
 
 		 840 aa  171  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  31.69 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.51 
 
 		 835 aa  170  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  30.12 
 
 		 835 aa  170  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  34.15 
 
 		 782 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 874 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  35.49 
 
 		 366 aa  167  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 		 810 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  34.36 
 
 		 809 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 812 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  41.16 
 
 		 867 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  34.32 
 
 		 798 aa  163  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.86 
 
 		 852 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.31 
 
 		 810 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  36.95 
 
 		 800 aa  162  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 		 760 aa  162  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.25 
 
 		 887 aa  161  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  34.59 
 
 		 762 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.39 
 
 		 794 aa  159  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  32.33 
 
 		 793 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  40.19 
 
 		 868 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  32.45 
 
 		 893 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  36.98 
 
 		 797 aa  157  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  37.57 
 
 		 796 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  33.65 
 
 		 334 aa  156  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  34.29 
 
 		 359 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  33.03 
 
 		 870 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 790 aa  154  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 414 aa  154  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.1 
 
 		 884 aa  154  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 		 796 aa  154  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  35.84 
 
 		 918 aa  153  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  35.67 
 
 		 799 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.37 
 
 		 830 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  35.38 
 
 		 765 aa  153  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 793 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  35.86 
 
 		 877 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  33.71 
 
 		 812 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  33.13 
 
 		 795 aa  152  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>