More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1849 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  49.35 
 
 
757 aa  744    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  54.12 
 
 
788 aa  775    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  70.53 
 
 
761 aa  1084    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  52.49 
 
 
799 aa  778    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  64.61 
 
 
758 aa  1019    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  54.46 
 
 
780 aa  799    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  49.15 
 
 
758 aa  736    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  49.48 
 
 
758 aa  747    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  70.98 
 
 
762 aa  1099    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  50.79 
 
 
769 aa  759    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  72.98 
 
 
761 aa  1130    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  54.7 
 
 
785 aa  794    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  53.98 
 
 
760 aa  763    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  58.27 
 
 
754 aa  856    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  49.54 
 
 
758 aa  751    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
762 aa  1544    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  53.61 
 
 
785 aa  775    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  41.13 
 
 
758 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 
758 aa  568  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 
758 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  42.91 
 
 
781 aa  562  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 
782 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  41.68 
 
 
824 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 
809 aa  511  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  39.67 
 
 
794 aa  509  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  39.1 
 
 
779 aa  498  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  40.94 
 
 
810 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 
765 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  38.13 
 
 
764 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.47 
 
 
812 aa  484  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.29 
 
 
810 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.63 
 
 
809 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  39.69 
 
 
791 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  40.08 
 
 
791 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  39.69 
 
 
791 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  39.31 
 
 
790 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  39.69 
 
 
791 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  39.57 
 
 
791 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  39.44 
 
 
791 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  38.8 
 
 
791 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  39.31 
 
 
792 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 
806 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  37.45 
 
 
795 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  37.34 
 
 
825 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  38.93 
 
 
790 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  38.4 
 
 
791 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  38.42 
 
 
801 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  38.98 
 
 
760 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  37.07 
 
 
819 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
798 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  38.3 
 
 
797 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  38.6 
 
 
795 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  37.41 
 
 
795 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 
790 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  38.32 
 
 
796 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  38.53 
 
 
778 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  36.22 
 
 
793 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  38.03 
 
 
793 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  36.59 
 
 
794 aa  438  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  37.71 
 
 
789 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  37.71 
 
 
789 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  37.22 
 
 
796 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  37.18 
 
 
801 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  38.2 
 
 
805 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  36.82 
 
 
821 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 
794 aa  435  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  36.85 
 
 
792 aa  435  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  36.59 
 
 
794 aa  435  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  37.68 
 
 
800 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  38.68 
 
 
810 aa  435  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  37.71 
 
 
789 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  38.22 
 
 
789 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 
803 aa  432  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  38.32 
 
 
795 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 
791 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  36.72 
 
 
805 aa  431  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  38.08 
 
 
803 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  39.42 
 
 
805 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  37.52 
 
 
805 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  37.59 
 
 
803 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
796 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  36.72 
 
 
795 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  36.85 
 
 
795 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
796 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  37.52 
 
 
806 aa  429  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 
837 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  38.32 
 
 
795 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 
789 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  37.99 
 
 
784 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
792 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  38.34 
 
 
794 aa  426  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  37.31 
 
 
801 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  37.79 
 
 
800 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  37.74 
 
 
806 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  37.52 
 
 
799 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 
796 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  36.65 
 
 
798 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  37.45 
 
 
789 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  36.78 
 
 
794 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  37.28 
 
 
801 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>