More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2466 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  42.36 
 
 		 809 aa  638    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  52.34 
 
 		 794 aa  814    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  49.24 
 
 		 758 aa  709    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  50.95 
 
 		 812 aa  795    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  67.95 
 
 		 781 aa  1133    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  43.76 
 
 		 832 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  43.25 
 
 		 839 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  48.98 
 
 		 758 aa  703    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  43.4 
 
 		 819 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  44.1 
 
 		 821 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  42.73 
 
 		 798 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  51.33 
 
 		 809 aa  791    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 782 aa  1617    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  43.09 
 
 		 793 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  44.38 
 
 		 790 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  58.93 
 
 		 764 aa  926    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  43.18 
 
 		 789 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  43.25 
 
 		 839 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  44.15 
 
 		 803 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  54.38 
 
 		 779 aa  836    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  52.9 
 
 		 810 aa  820    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  52.4 
 
 		 824 aa  805    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  52.9 
 
 		 809 aa  825    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  48.98 
 
 		 758 aa  712    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  41.6 
 
 		 825 aa  635  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  43.35 
 
 		 806 aa  628  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  44.11 
 
 		 769 aa  626  1e-178  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  44.32 
 
 		 760 aa  628  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  42.81 
 
 		 837 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  42.52 
 
 		 812 aa  622  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  43.17 
 
 		 803 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  42.35 
 
 		 805 aa  622  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  41.6 
 
 		 790 aa  620  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  43.71 
 
 		 806 aa  620  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  42.57 
 
 		 791 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  43.07 
 
 		 791 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  41.97 
 
 		 806 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  44.49 
 
 		 788 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  42.33 
 
 		 805 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  41.88 
 
 		 805 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  42.32 
 
 		 791 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  42.2 
 
 		 791 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  43 
 
 		 791 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  43.33 
 
 		 794 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  41.44 
 
 		 838 aa  616  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  41.53 
 
 		 812 aa  618  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  42.22 
 
 		 796 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  42.12 
 
 		 796 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  42.26 
 
 		 790 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  44.81 
 
 		 754 aa  618  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  42.22 
 
 		 791 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  42.28 
 
 		 803 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  41.95 
 
 		 791 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 		 800 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 		 800 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  42.93 
 
 		 799 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 		 800 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 799 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  42.54 
 
 		 801 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  43.37 
 
 		 758 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  42.56 
 
 		 791 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 		 799 aa  611  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  42.96 
 
 		 792 aa  609  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 812 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  42.55 
 
 		 800 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 		 800 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  42.43 
 
 		 795 aa  609  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 799 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  42.84 
 
 		 792 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  42.59 
 
 		 791 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  42.71 
 
 		 792 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  42.93 
 
 		 778 aa  609  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  43.53 
 
 		 757 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 799 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  43.36 
 
 		 790 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 799 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  42.14 
 
 		 790 aa  608  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 799 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  43.29 
 
 		 789 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  42.47 
 
 		 801 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  42.55 
 
 		 794 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  43 
 
 		 758 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  42.32 
 
 		 815 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 799 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 799 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  42.8 
 
 		 799 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  43.04 
 
 		 765 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  42.53 
 
 		 798 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  42.24 
 
 		 815 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  43.42 
 
 		 799 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  42.19 
 
 		 792 aa  605  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  42.53 
 
 		 793 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  43.42 
 
 		 799 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  42.24 
 
 		 796 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 		 803 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 		 803 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  41.53 
 
 		 796 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  42.36 
 
 		 800 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  40.93 
 
 		 789 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  41.53 
 
 		 796 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>