More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1888 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  45.42 
 
 		 758 aa  639    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  57.94 
 
 		 794 aa  894    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  45.29 
 
 		 758 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  80.3 
 
 		 812 aa  1364    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  52.96 
 
 		 781 aa  812    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  42.75 
 
 		 825 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  88.64 
 
 		 810 aa  1465    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  83.83 
 
 		 809 aa  1383    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  50.7 
 
 		 764 aa  761    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  57.6 
 
 		 779 aa  904    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  52.9 
 
 		 782 aa  825    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  45.42 
 
 		 758 aa  635    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  61.57 
 
 		 824 aa  976    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 809 aa  1634    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  42.82 
 
 		 809 aa  631  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  41.95 
 
 		 837 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  43.03 
 
 		 803 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  42.29 
 
 		 832 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  42.32 
 
 		 805 aa  623  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  42.87 
 
 		 798 aa  621  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  44.31 
 
 		 806 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  43.44 
 
 		 790 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  42.61 
 
 		 794 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  45.3 
 
 		 760 aa  612  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  41.48 
 
 		 821 aa  608  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  44.19 
 
 		 769 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  42.4 
 
 		 791 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  42.31 
 
 		 789 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  42.31 
 
 		 789 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  43.32 
 
 		 814 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  41.62 
 
 		 803 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  42.57 
 
 		 792 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  42.31 
 
 		 789 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  45.2 
 
 		 754 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  42.4 
 
 		 791 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  42.27 
 
 		 791 aa  602  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  41.4 
 
 		 819 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  42.52 
 
 		 791 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  40.83 
 
 		 838 aa  602  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  42.43 
 
 		 789 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  42.27 
 
 		 791 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  41.62 
 
 		 790 aa  599  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  40.45 
 
 		 839 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  43.08 
 
 		 815 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 		 790 aa  598  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 		 797 aa  598  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  40.45 
 
 		 839 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  43.05 
 
 		 795 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  41.65 
 
 		 790 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  42.5 
 
 		 799 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  42.14 
 
 		 803 aa  592  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 		 800 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 792 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  42.07 
 
 		 796 aa  595  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  42.04 
 
 		 793 aa  592  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  42.89 
 
 		 790 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  42.25 
 
 		 786 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  42.33 
 
 		 789 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 		 796 aa  590  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  41.67 
 
 		 805 aa  591  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  41.77 
 
 		 799 aa  592  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  42.2 
 
 		 789 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 791 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0548  phosphoenolpyruvate synthase  42.38 
 
 		 799 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.485187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 791 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 		 796 aa  590  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  41.77 
 
 		 799 aa  592  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  42.18 
 
 		 789 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  41.58 
 
 		 815 aa  589  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  41.65 
 
 		 791 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  41.79 
 
 		 800 aa  591  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  41.7 
 
 		 793 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 		 789 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  40.56 
 
 		 805 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  41.99 
 
 		 806 aa  589  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  42.91 
 
 		 778 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  42.75 
 
 		 799 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  42.73 
 
 		 758 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  42.47 
 
 		 812 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  42.7 
 
 		 810 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  41.68 
 
 		 801 aa  588  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  43.93 
 
 		 757 aa  587  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  41.55 
 
 		 791 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  41.35 
 
 		 804 aa  587  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 		 792 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  41.39 
 
 		 794 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  41.71 
 
 		 803 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  43.06 
 
 		 758 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 		 792 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  41.29 
 
 		 796 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 		 792 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 		 792 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  41.12 
 
 		 806 aa  579  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  42.09 
 
 		 795 aa  582  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  41.06 
 
 		 792 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 		 792 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  41.87 
 
 		 797 aa  582  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  40.95 
 
 		 796 aa  579  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  41.02 
 
 		 794 aa  580  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  40.82 
 
 		 789 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>