More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12720 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  50.64 
 
 
794 aa  766    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  46.48 
 
 
758 aa  665    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  50.63 
 
 
810 aa  767    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  49.62 
 
 
812 aa  757    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  59.34 
 
 
781 aa  953    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  46.35 
 
 
758 aa  657    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
764 aa  1561    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  58.93 
 
 
782 aa  947    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  46.48 
 
 
758 aa  666    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  51.68 
 
 
779 aa  781    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  54.48 
 
 
824 aa  811    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  50.7 
 
 
809 aa  779    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  50.57 
 
 
809 aa  751    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  43.46 
 
 
803 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  42.03 
 
 
798 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  41.92 
 
 
794 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  42.1 
 
 
798 aa  612  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  44.08 
 
 
790 aa  611  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 
789 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  42.78 
 
 
795 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 
789 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  42.42 
 
 
789 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  42.23 
 
 
794 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 
789 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  42.61 
 
 
790 aa  608  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 
789 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  41.32 
 
 
792 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  41.95 
 
 
792 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  43.23 
 
 
796 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  41.58 
 
 
789 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  43.79 
 
 
796 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  41.32 
 
 
792 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  41.67 
 
 
792 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  42.28 
 
 
794 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  42.43 
 
 
794 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  41.78 
 
 
789 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  41.32 
 
 
792 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 
790 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  42.25 
 
 
760 aa  605  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  43.79 
 
 
796 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  41.95 
 
 
792 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 
792 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 
789 aa  601  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 
792 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 
792 aa  601  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  41.32 
 
 
792 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  42.77 
 
 
796 aa  602  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  41.95 
 
 
792 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 
792 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  41.79 
 
 
792 aa  602  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 
792 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 
792 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  41.2 
 
 
792 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  41.28 
 
 
789 aa  599  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  42.86 
 
 
793 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
792 aa  598  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  40.9 
 
 
789 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  42.19 
 
 
795 aa  596  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  41.98 
 
 
791 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  41.68 
 
 
794 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  41.02 
 
 
792 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
790 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 
792 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  42.01 
 
 
796 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  41.77 
 
 
790 aa  598  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  41.65 
 
 
803 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  41.44 
 
 
789 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
792 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  42.55 
 
 
801 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 
791 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  42.19 
 
 
795 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 
791 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  41.83 
 
 
795 aa  595  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  41.41 
 
 
791 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  41.44 
 
 
789 aa  595  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  42.19 
 
 
812 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 
791 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  41.5 
 
 
790 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  42.18 
 
 
795 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  42.61 
 
 
799 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  40.81 
 
 
810 aa  591  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  41.61 
 
 
801 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  41.77 
 
 
787 aa  589  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 
792 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  39.93 
 
 
819 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  43.47 
 
 
788 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  40.88 
 
 
795 aa  590  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  42.05 
 
 
795 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  41.8 
 
 
794 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 
791 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  42.28 
 
 
815 aa  589  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  41.78 
 
 
808 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 
791 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  41.8 
 
 
794 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  41.8 
 
 
794 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  40.22 
 
 
812 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  42.69 
 
 
778 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  39.9 
 
 
837 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  41.67 
 
 
800 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  42.2 
 
 
801 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>