More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0588 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  62.18 
 
 
810 aa  971    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  56.05 
 
 
794 aa  869    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  45.23 
 
 
758 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  45.43 
 
 
803 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  43.51 
 
 
837 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  45.25 
 
 
797 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  43.97 
 
 
794 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  43.83 
 
 
819 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  45.03 
 
 
798 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  44.74 
 
 
796 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  54.48 
 
 
764 aa  795    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  45.54 
 
 
812 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  44.76 
 
 
796 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  45.55 
 
 
758 aa  640    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  44.26 
 
 
809 aa  641    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  45.04 
 
 
792 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  44.76 
 
 
796 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  47.42 
 
 
806 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  43.63 
 
 
832 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  43.95 
 
 
825 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  45.12 
 
 
793 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  44.99 
 
 
789 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  45.86 
 
 
758 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  52.4 
 
 
782 aa  805    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  46.49 
 
 
754 aa  651    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  61.22 
 
 
809 aa  952    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  60.2 
 
 
812 aa  942    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  57.97 
 
 
779 aa  882    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
824 aa  1664    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  61.57 
 
 
809 aa  976    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  57.52 
 
 
781 aa  886    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  44.99 
 
 
789 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  43.8 
 
 
821 aa  632  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  44.32 
 
 
803 aa  635  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  43.97 
 
 
794 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  44.87 
 
 
789 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  44.99 
 
 
789 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  44.75 
 
 
789 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  44.62 
 
 
789 aa  632  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  45.48 
 
 
791 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  45.13 
 
 
794 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  45.48 
 
 
791 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  44.54 
 
 
789 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  44.54 
 
 
789 aa  632  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  45.48 
 
 
791 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  44.5 
 
 
796 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  42.51 
 
 
839 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  45.23 
 
 
801 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  42.51 
 
 
839 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  45.23 
 
 
791 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  44.62 
 
 
789 aa  627  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  44.97 
 
 
789 aa  628  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  45.51 
 
 
800 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  43.8 
 
 
789 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  45.48 
 
 
795 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  44.49 
 
 
789 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  45.23 
 
 
790 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  45.16 
 
 
803 aa  625  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  45.08 
 
 
805 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  43.68 
 
 
806 aa  622  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  44 
 
 
789 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  44.57 
 
 
814 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  43.96 
 
 
794 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  45.42 
 
 
791 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  44.03 
 
 
801 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  43.96 
 
 
799 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  45.35 
 
 
792 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  44.13 
 
 
808 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  44.51 
 
 
795 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  44.62 
 
 
805 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  43.89 
 
 
797 aa  621  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  46.05 
 
 
778 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  44.91 
 
 
790 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  44.64 
 
 
795 aa  618  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  44.27 
 
 
795 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0548  phosphoenolpyruvate synthase  44.76 
 
 
799 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.485187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  44.51 
 
 
794 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  43.85 
 
 
805 aa  615  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  43.18 
 
 
790 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  44.32 
 
 
803 aa  618  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  45.29 
 
 
757 aa  616  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  44.85 
 
 
800 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  43.3 
 
 
791 aa  618  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  44.86 
 
 
791 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  45.14 
 
 
801 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  44.01 
 
 
805 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  44.22 
 
 
792 aa  615  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  42.79 
 
 
795 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  43.44 
 
 
791 aa  612  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  44.76 
 
 
799 aa  615  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  43.03 
 
 
838 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  44.06 
 
 
799 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  44.31 
 
 
799 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  44.75 
 
 
810 aa  614  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  44.03 
 
 
790 aa  614  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  43.67 
 
 
792 aa  611  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  44.53 
 
 
791 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  43.67 
 
 
792 aa  611  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  43.87 
 
 
799 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  44.06 
 
 
800 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>