More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2191 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  46.01 
 
 		 911 aa  717    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  64.39 
 
 		 792 aa  1050    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  64.65 
 
 		 792 aa  1053    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  84.25 
 
 		 799 aa  1415    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  64.65 
 
 		 792 aa  1053    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  63.27 
 
 		 795 aa  1028    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  51.39 
 
 		 805 aa  802    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  66.24 
 
 		 791 aa  1070    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  66.88 
 
 		 790 aa  1084    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  75.94 
 
 		 795 aa  1256    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  74.27 
 
 		 799 aa  1229    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3011  phosphoenolpyruvate synthase  62.07 
 
 		 795 aa  1012    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  75.54 
 
 		 801 aa  1241    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  64.21 
 
 		 789 aa  1029    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  66.37 
 
 		 791 aa  1061    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  66.37 
 
 		 791 aa  1071    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  66.75 
 
 		 792 aa  1083    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  64.47 
 
 		 789 aa  1050    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  74.27 
 
 		 799 aa  1229    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  63.38 
 
 		 795 aa  1037    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  63.26 
 
 		 795 aa  1035    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  66.37 
 
 		 791 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  63.35 
 
 		 794 aa  1035    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  69.28 
 
 		 791 aa  1129    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  47.66 
 
 		 799 aa  743    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  76.47 
 
 		 794 aa  1275    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  50.89 
 
 		 815 aa  791    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  50.75 
 
 		 803 aa  805    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  64.65 
 
 		 792 aa  1053    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  64.09 
 
 		 779 aa  991    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  62.76 
 
 		 803 aa  1006    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  53.91 
 
 		 819 aa  870    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  53.39 
 
 		 821 aa  878    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  74.27 
 
 		 799 aa  1229    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  50.06 
 
 		 794 aa  771    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  65.86 
 
 		 791 aa  1059    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  52.48 
 
 		 798 aa  826    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  74.27 
 
 		 812 aa  1228    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  74.84 
 
 		 800 aa  1234    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  51.77 
 
 		 800 aa  807    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6481  phosphoenolpyruvate synthase  51.52 
 
 		 811 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237379  normal  0.463412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  82.27 
 
 		 784 aa  1347    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  64.02 
 
 		 792 aa  1039    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  52.53 
 
 		 804 aa  828    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  63.96 
 
 		 792 aa  1039    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  53.38 
 
 		 838 aa  838    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  65.22 
 
 		 795 aa  1055    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  63.15 
 
 		 790 aa  1016    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  74.4 
 
 		 799 aa  1230    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  81.6 
 
 		 801 aa  1361    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  63.28 
 
 		 798 aa  1035    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 799 aa  1646    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  65.91 
 
 		 789 aa  1078    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  50.51 
 
 		 825 aa  786    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  84.75 
 
 		 799 aa  1417    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  75.09 
 
 		 800 aa  1234    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  63.58 
 
 		 791 aa  1025    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  51.97 
 
 		 801 aa  816    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  63.19 
 
 		 796 aa  1021    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  49.87 
 
 		 821 aa  783    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  63.22 
 
 		 794 aa  1032    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  76.22 
 
 		 794 aa  1267    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  65.31 
 
 		 793 aa  1034    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  74.59 
 
 		 800 aa  1230    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  53.86 
 
 		 798 aa  862    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  62.56 
 
 		 795 aa  1016    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  50.76 
 
 		 806 aa  778    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  62.69 
 
 		 791 aa  1008    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2594  phosphoenolpyruvate synthase  48.94 
 
 		 812 aa  782    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  63.41 
 
 		 789 aa  1022    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  51.95 
 
 		 825 aa  842    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  64.09 
 
 		 789 aa  1028    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  66.12 
 
 		 815 aa  1060    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  64.34 
 
 		 808 aa  1023    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  74.65 
 
 		 799 aa  1234    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  85.09 
 
 		 796 aa  1420    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  66.62 
 
 		 791 aa  1081    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  52.31 
 
 		 812 aa  780    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  52.27 
 
 		 793 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  64.47 
 
 		 789 aa  1036    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  62.71 
 
 		 790 aa  1035    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  63.68 
 
 		 805 aa  1030    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  64.47 
 
 		 789 aa  1050    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  53.86 
 
 		 798 aa  862    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  74.59 
 
 		 800 aa  1230    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  64.16 
 
 		 794 aa  1045    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  64.59 
 
 		 789 aa  1032    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  74.27 
 
 		 799 aa  1229    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  51 
 
 		 806 aa  823    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  51.7 
 
 		 803 aa  813    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  64.21 
 
 		 789 aa  1030    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  51.01 
 
 		 805 aa  803    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  74.27 
 
 		 799 aa  1229    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  64.72 
 
 		 789 aa  1038    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  63.45 
 
 		 789 aa  1017    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  53.86 
 
 		 798 aa  862    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  74.27 
 
 		 799 aa  1229    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  84.94 
 
 		 796 aa  1412    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  53.69 
 
 		 798 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  67.31 
 
 		 778 aa  1078    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>