More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_494 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  97.63 
 
 		 758 aa  1518    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  96.17 
 
 		 758 aa  1494    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  48.98 
 
 		 782 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 		 758 aa  1551    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  46.48 
 
 		 764 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  45.12 
 
 		 779 aa  638    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  43.53 
 
 		 769 aa  643    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  49.36 
 
 		 781 aa  718    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  45.49 
 
 		 824 aa  640    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  45.42 
 
 		 809 aa  639    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  43.29 
 
 		 757 aa  634  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.01 
 
 		 810 aa  631  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  44.14 
 
 		 758 aa  631  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  44.01 
 
 		 758 aa  628  1e-178  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  44.71 
 
 		 810 aa  622  1e-177  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  44.3 
 
 		 812 aa  624  1e-177  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  43.48 
 
 		 758 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  44.44 
 
 		 754 aa  622  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  44.24 
 
 		 765 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  44.6 
 
 		 809 aa  617  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  43.58 
 
 		 794 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  42.18 
 
 		 790 aa  590  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  42.49 
 
 		 792 aa  588  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  41.5 
 
 		 762 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  42.37 
 
 		 792 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  41.4 
 
 		 792 aa  582  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  41.88 
 
 		 798 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  41.83 
 
 		 825 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  41.7 
 
 		 815 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  42.01 
 
 		 758 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  42.58 
 
 		 792 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  41.87 
 
 		 795 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 800 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  40.82 
 
 		 793 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 800 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  42.11 
 
 		 792 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 799 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  41.24 
 
 		 810 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 800 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 799 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  40.94 
 
 		 801 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 799 aa  571  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  41.02 
 
 		 792 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  40.97 
 
 		 792 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  40.93 
 
 		 791 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  40.95 
 
 		 789 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  41.41 
 
 		 791 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  41.47 
 
 		 794 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  42.22 
 
 		 761 aa  570  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 		 792 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  41.44 
 
 		 803 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  41.61 
 
 		 795 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  41.78 
 
 		 789 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  40.97 
 
 		 792 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  41.44 
 
 		 799 aa  571  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  40.95 
 
 		 789 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  41.02 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  41.43 
 
 		 809 aa  567  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  41.1 
 
 		 795 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  41.71 
 
 		 789 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  39.67 
 
 		 794 aa  567  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  40.84 
 
 		 792 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  40.93 
 
 		 791 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  41.2 
 
 		 800 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  40.76 
 
 		 792 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  40.78 
 
 		 789 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  40.84 
 
 		 792 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  40.98 
 
 		 792 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  40.68 
 
 		 791 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  40.84 
 
 		 792 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  39.88 
 
 		 794 aa  568  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  42.62 
 
 		 793 aa  565  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  40.95 
 
 		 789 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  40.85 
 
 		 791 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  41.02 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  40.98 
 
 		 790 aa  568  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 		 791 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 		 791 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  40.93 
 
 		 791 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  41.07 
 
 		 791 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  40.48 
 
 		 790 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  40.74 
 
 		 804 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  41.08 
 
 		 789 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 		 795 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 780 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  42.05 
 
 		 801 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  41.5 
 
 		 798 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  41.33 
 
 		 789 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 		 785 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  41.5 
 
 		 798 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  40.65 
 
 		 789 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  41.46 
 
 		 789 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  41.46 
 
 		 789 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  41.5 
 
 		 798 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  41.12 
 
 		 790 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>