More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0490 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  50.73 
 
 
761 aa  723    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  50.12 
 
 
799 aa  744    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  86.15 
 
 
757 aa  1359    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  49.28 
 
 
762 aa  712    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  49.41 
 
 
760 aa  721    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  51.91 
 
 
761 aa  744    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  50.13 
 
 
758 aa  739    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  49.87 
 
 
762 aa  739    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
758 aa  1544    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  49.62 
 
 
788 aa  738    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  93.8 
 
 
758 aa  1449    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  73.33 
 
 
769 aa  1157    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  49.62 
 
 
785 aa  747    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  50.25 
 
 
780 aa  750    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  50.31 
 
 
785 aa  739    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  95.38 
 
 
758 aa  1484    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  53.68 
 
 
754 aa  794    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  44.53 
 
 
758 aa  634  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  44.64 
 
 
781 aa  634  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  43.61 
 
 
758 aa  629  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  44.01 
 
 
758 aa  628  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  43.37 
 
 
782 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  44.47 
 
 
824 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  42.73 
 
 
809 aa  587  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  42.24 
 
 
810 aa  569  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  41.75 
 
 
812 aa  566  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  41.91 
 
 
809 aa  560  1e-158  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  42.38 
 
 
764 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 
794 aa  545  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  41.14 
 
 
779 aa  533  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.61 
 
 
810 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  39.47 
 
 
765 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  40.45 
 
 
798 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 
825 aa  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  39.3 
 
 
800 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  38.76 
 
 
793 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  39.42 
 
 
760 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  38.66 
 
 
803 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 
809 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  38.73 
 
 
806 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  37.77 
 
 
790 aa  475  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  39.03 
 
 
803 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  38.28 
 
 
793 aa  469  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  39.11 
 
 
810 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  38.78 
 
 
799 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  39.43 
 
 
805 aa  467  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  38.78 
 
 
799 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
796 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
796 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  38.35 
 
 
791 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 
796 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  38.4 
 
 
791 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  38.5 
 
 
790 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  38.71 
 
 
795 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  38.35 
 
 
791 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  37.55 
 
 
806 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  37.24 
 
 
812 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  38.48 
 
 
796 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  38.23 
 
 
791 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  36.76 
 
 
837 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  37.45 
 
 
819 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  38.47 
 
 
791 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  37.1 
 
 
832 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 
803 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
792 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  38.28 
 
 
791 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  38.78 
 
 
805 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  37.52 
 
 
790 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  37.96 
 
 
791 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  36.33 
 
 
799 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  36.7 
 
 
839 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  37.52 
 
 
812 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 
795 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  38.45 
 
 
790 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  39.15 
 
 
778 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  37.45 
 
 
801 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  37.96 
 
 
791 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 
795 aa  452  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  38.35 
 
 
794 aa  452  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  37.6 
 
 
791 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  37.77 
 
 
790 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 
803 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
794 aa  452  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  36.5 
 
 
804 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  38.71 
 
 
795 aa  452  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  36.82 
 
 
839 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  37.85 
 
 
789 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  38.91 
 
 
797 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  37.33 
 
 
805 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  36.73 
 
 
911 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 
805 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  36.99 
 
 
803 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 
815 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  37.93 
 
 
786 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  36.02 
 
 
804 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  36.67 
 
 
838 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 
798 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 
798 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  36.99 
 
 
803 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 
798 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>