More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1445 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  54.8 
 
 
794 aa  844    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  52.97 
 
 
781 aa  811    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  79.12 
 
 
809 aa  1319    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  49.62 
 
 
764 aa  744    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  81.7 
 
 
810 aa  1350    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  56.41 
 
 
779 aa  878    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
812 aa  1634    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  50.88 
 
 
782 aa  801    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  60.66 
 
 
824 aa  951    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  80.3 
 
 
809 aa  1372    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  43.01 
 
 
809 aa  629  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  44.23 
 
 
758 aa  625  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  44.22 
 
 
758 aa  625  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  45.5 
 
 
806 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  43.71 
 
 
758 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  42.84 
 
 
805 aa  614  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  42.7 
 
 
803 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  42.59 
 
 
794 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  41.6 
 
 
832 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  44.08 
 
 
790 aa  604  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  41.05 
 
 
825 aa  604  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  40.81 
 
 
837 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  43.06 
 
 
769 aa  597  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  42.45 
 
 
791 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 
798 aa  598  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  42.56 
 
 
812 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  42.31 
 
 
791 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  42.07 
 
 
791 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  42.24 
 
 
789 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  42.07 
 
 
792 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  40.97 
 
 
819 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 
821 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  42.31 
 
 
791 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  40.74 
 
 
838 aa  593  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  40.33 
 
 
839 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  42.24 
 
 
789 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  42.09 
 
 
790 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 
791 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  42.24 
 
 
789 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  42.36 
 
 
789 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  41.04 
 
 
790 aa  591  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  42.84 
 
 
814 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  41.78 
 
 
792 aa  592  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  41.69 
 
 
792 aa  592  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  40.33 
 
 
839 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  41.68 
 
 
815 aa  591  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  41.28 
 
 
792 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  43.9 
 
 
760 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 
794 aa  587  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 
797 aa  587  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 
815 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 
792 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 
792 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  42.07 
 
 
792 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  41.31 
 
 
794 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 
800 aa  587  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  42.19 
 
 
791 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  43.05 
 
 
810 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  41.42 
 
 
792 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
792 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  41.96 
 
 
796 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  42.29 
 
 
789 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  41.47 
 
 
791 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 
791 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  42.77 
 
 
795 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  41.42 
 
 
792 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  41.29 
 
 
792 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  41.96 
 
 
796 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
792 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
792 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 
792 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  42.57 
 
 
790 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
792 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 
790 aa  585  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  41.42 
 
 
792 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  43.82 
 
 
754 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  42.79 
 
 
786 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  42.05 
 
 
789 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
792 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 
792 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 
792 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  41.44 
 
 
792 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  41.74 
 
 
795 aa  582  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  40.57 
 
 
792 aa  579  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  42.21 
 
 
796 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  41.15 
 
 
806 aa  579  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  41.89 
 
 
791 aa  581  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  42.17 
 
 
789 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  41.83 
 
 
796 aa  581  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  42.17 
 
 
789 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  41.55 
 
 
805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  42.05 
 
 
803 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  41.19 
 
 
803 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  43.5 
 
 
779 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  42.52 
 
 
793 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  41.5 
 
 
794 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  41.69 
 
 
790 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  40.34 
 
 
805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  41.8 
 
 
789 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  42.07 
 
 
778 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>