More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1544 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  50.57 
 
 
785 aa  762    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  51.28 
 
 
780 aa  765    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  51.06 
 
 
769 aa  771    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  50.06 
 
 
799 aa  754    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
758 aa  1565    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  65.3 
 
 
762 aa  1016    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  64.61 
 
 
762 aa  1006    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  49.74 
 
 
757 aa  743    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  64.74 
 
 
761 aa  1004    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  49.08 
 
 
758 aa  738    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  50.13 
 
 
758 aa  746    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  49.55 
 
 
785 aa  741    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  49.36 
 
 
788 aa  738    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  65.92 
 
 
761 aa  1028    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  50.13 
 
 
758 aa  756    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  48.68 
 
 
760 aa  727    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  55.51 
 
 
754 aa  833    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  42.95 
 
 
781 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  42.27 
 
 
758 aa  586  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  42.01 
 
 
758 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  42.27 
 
 
758 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  41.58 
 
 
782 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  38.68 
 
 
824 aa  538  1e-151  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  38.8 
 
 
794 aa  523  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  38.41 
 
 
779 aa  506  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  38.33 
 
 
809 aa  502  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  38.61 
 
 
810 aa  499  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  37.22 
 
 
764 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  38.9 
 
 
812 aa  491  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  37.87 
 
 
809 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 
765 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  36.09 
 
 
798 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  36.68 
 
 
825 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.09 
 
 
810 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  37.77 
 
 
791 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  36.21 
 
 
809 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  37.69 
 
 
791 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  37.64 
 
 
791 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  37.64 
 
 
791 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  37.44 
 
 
792 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  37.87 
 
 
791 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  37.94 
 
 
791 aa  459  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  36.57 
 
 
805 aa  457  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 
760 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  36.58 
 
 
795 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  37.28 
 
 
790 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  37.47 
 
 
791 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  36.98 
 
 
796 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  38.15 
 
 
795 aa  452  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  36.43 
 
 
795 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  36.21 
 
 
837 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  37.44 
 
 
791 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  36.26 
 
 
790 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  36.86 
 
 
793 aa  448  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  35.69 
 
 
800 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  37.45 
 
 
796 aa  446  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  35.62 
 
 
793 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  35.67 
 
 
812 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  36.89 
 
 
806 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  36.32 
 
 
790 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  36.24 
 
 
794 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  35.72 
 
 
821 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  36.4 
 
 
787 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  36.29 
 
 
803 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  34.52 
 
 
792 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  36.24 
 
 
794 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  36.43 
 
 
790 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  36.76 
 
 
801 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  34.5 
 
 
792 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  36.4 
 
 
797 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  37.18 
 
 
795 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  34.5 
 
 
792 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  34.5 
 
 
792 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  35.52 
 
 
819 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  36.12 
 
 
800 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 
798 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  34.5 
 
 
792 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  34.5 
 
 
792 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  35.96 
 
 
799 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  36.43 
 
 
801 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  36.5 
 
 
799 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  36.03 
 
 
790 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  35.79 
 
 
779 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  36.29 
 
 
799 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  36.02 
 
 
799 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  36 
 
 
800 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  34.87 
 
 
792 aa  435  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  35.83 
 
 
789 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  36 
 
 
800 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  36 
 
 
800 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  36.5 
 
 
799 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  37.06 
 
 
795 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  35.16 
 
 
791 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  34.37 
 
 
797 aa  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 
792 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  36.68 
 
 
795 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  36.17 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  36.17 
 
 
799 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 
803 aa  432  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  35.4 
 
 
805 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>