More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4990 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
765 aa  1542    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  54.56 
 
 
810 aa  785    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  44.24 
 
 
758 aa  619  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  43.97 
 
 
758 aa  616  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  43.41 
 
 
781 aa  608  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  43.04 
 
 
782 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  43.43 
 
 
758 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  43.73 
 
 
779 aa  588  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  41.35 
 
 
794 aa  568  1e-160  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 
809 aa  561  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  42.19 
 
 
824 aa  555  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  41.31 
 
 
764 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  39.71 
 
 
757 aa  536  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  41.59 
 
 
810 aa  538  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  40.31 
 
 
769 aa  535  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  39.04 
 
 
758 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  39.31 
 
 
758 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  39.47 
 
 
758 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.95 
 
 
812 aa  532  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.8 
 
 
809 aa  526  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  41.2 
 
 
754 aa  504  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  40.25 
 
 
788 aa  500  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  39.67 
 
 
780 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  41.48 
 
 
760 aa  496  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  39.5 
 
 
761 aa  491  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  39.67 
 
 
785 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  38.7 
 
 
791 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  38.59 
 
 
799 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  38.33 
 
 
791 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  38.49 
 
 
791 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  38.91 
 
 
761 aa  479  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 
762 aa  479  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 
785 aa  478  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  38.39 
 
 
762 aa  472  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  38.66 
 
 
790 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 
758 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 
791 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 
791 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  38.49 
 
 
791 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 
791 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  39.37 
 
 
790 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  38.45 
 
 
791 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  38.7 
 
 
792 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  39.06 
 
 
825 aa  465  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 
760 aa  461  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  37.44 
 
 
812 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 
803 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  39.8 
 
 
803 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  38.85 
 
 
789 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  38.95 
 
 
803 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  38.05 
 
 
800 aa  458  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  37.48 
 
 
801 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  36.88 
 
 
794 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6481  phosphoenolpyruvate synthase  38.61 
 
 
811 aa  459  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237379  normal  0.463412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  38.25 
 
 
798 aa  458  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  38.15 
 
 
804 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 
794 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  40.4 
 
 
798 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  38.27 
 
 
790 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  40.4 
 
 
798 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  36.72 
 
 
809 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  40.4 
 
 
798 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  38.67 
 
 
803 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  36.71 
 
 
805 aa  455  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
800 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  36.61 
 
 
793 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
800 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  37.24 
 
 
815 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 
800 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  37.77 
 
 
795 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 
795 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  36.4 
 
 
795 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  38.18 
 
 
819 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  37.3 
 
 
800 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  36.92 
 
 
800 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  37.36 
 
 
799 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  39.43 
 
 
814 aa  452  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  37.36 
 
 
799 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  37.62 
 
 
806 aa  450  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  39.95 
 
 
805 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  36.98 
 
 
799 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  38.9 
 
 
805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  38.57 
 
 
806 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 
821 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  38.14 
 
 
794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  36.32 
 
 
790 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  39.6 
 
 
800 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  37.22 
 
 
799 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  37.31 
 
 
794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  36.62 
 
 
801 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 
801 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  37.64 
 
 
795 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  37.97 
 
 
787 aa  448  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  37.88 
 
 
801 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  37.25 
 
 
815 aa  446  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  37.09 
 
 
799 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  37.52 
 
 
795 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  38.66 
 
 
799 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  38.66 
 
 
799 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  40.18 
 
 
798 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>