More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6941 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  41.82 
 
 		 758 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 810 aa  1601    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  54.56 
 
 		 765 aa  792    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 758 aa  632  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 758 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 		 781 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 782 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  40.6 
 
 		 779 aa  561  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 		 764 aa  545  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  38.71 
 
 		 824 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 		 809 aa  538  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  38.61 
 
 		 758 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  40.05 
 
 		 812 aa  533  1e-150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  39.23 
 
 		 810 aa  535  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  38.22 
 
 		 794 aa  531  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  37.62 
 
 		 757 aa  531  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  38.55 
 
 		 758 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  38.37 
 
 		 758 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  38.47 
 
 		 769 aa  524  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  38.84 
 
 		 809 aa  513  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  40.75 
 
 		 788 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 785 aa  504  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  40.85 
 
 		 760 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  39.03 
 
 		 754 aa  504  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 		 780 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  39.33 
 
 		 799 aa  494  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  40.1 
 
 		 785 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 		 761 aa  477  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  35.5 
 
 		 758 aa  464  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 800 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  38.64 
 
 		 790 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  39.51 
 
 		 825 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  37.19 
 
 		 787 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  38.43 
 
 		 810 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  34.79 
 
 		 793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  34.47 
 
 		 809 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  37.13 
 
 		 761 aa  455  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 		 821 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  37.49 
 
 		 805 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  38.13 
 
 		 760 aa  451  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  36.55 
 
 		 792 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  39.15 
 
 		 786 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  34.32 
 
 		 805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  36.06 
 
 		 803 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  36.89 
 
 		 789 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  35.6 
 
 		 791 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 		 799 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 		 796 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  35.92 
 
 		 800 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  36.79 
 
 		 801 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  35.95 
 
 		 792 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  35.76 
 
 		 815 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  36.11 
 
 		 799 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  37.45 
 
 		 805 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  35.36 
 
 		 791 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  35.14 
 
 		 806 aa  439  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 		 800 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  35.09 
 
 		 804 aa  439  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  36 
 
 		 799 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  35.02 
 
 		 803 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 		 800 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 825 aa  439  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 		 812 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 		 799 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 		 800 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  35.59 
 
 		 798 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  35.39 
 
 		 789 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  35.01 
 
 		 791 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  34.99 
 
 		 792 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  39.28 
 
 		 779 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 		 821 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  35.59 
 
 		 794 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  35.34 
 
 		 791 aa  435  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  36.88 
 
 		 798 aa  436  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  35.39 
 
 		 789 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  35.35 
 
 		 792 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  35.36 
 
 		 791 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  37.72 
 
 		 793 aa  434  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  34.52 
 
 		 790 aa  433  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  35.31 
 
 		 808 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  35.5 
 
 		 792 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  35.39 
 
 		 792 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  36.29 
 
 		 790 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  35.38 
 
 		 792 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  35.61 
 
 		 795 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  33.45 
 
 		 794 aa  432  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  36.62 
 
 		 784 aa  432  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  36.24 
 
 		 799 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  35.76 
 
 		 799 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  35.39 
 
 		 792 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  36.11 
 
 		 801 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  35.38 
 
 		 792 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  35.34 
 
 		 805 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  35.39 
 
 		 792 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>