More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2243 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  47.04 
 
 
911 aa  743    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  74.81 
 
 
792 aa  1251    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  74.81 
 
 
792 aa  1253    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  52.35 
 
 
821 aa  834    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  52.17 
 
 
806 aa  843    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  69.08 
 
 
795 aa  1159    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  53.35 
 
 
805 aa  862    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  69.71 
 
 
791 aa  1171    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  51.95 
 
 
803 aa  849    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  67.68 
 
 
790 aa  1139    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  64.8 
 
 
795 aa  1065    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  88.96 
 
 
789 aa  1449    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3011  phosphoenolpyruvate synthase  75.92 
 
 
795 aa  1250    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  50.51 
 
 
812 aa  792    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  98.35 
 
 
789 aa  1603    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  68.27 
 
 
791 aa  1151    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
812 aa  1052    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  53.4 
 
 
798 aa  851    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  96.58 
 
 
789 aa  1582    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  89.21 
 
 
790 aa  1459    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
799 aa  1053    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
799 aa  1053    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  67.17 
 
 
795 aa  1120    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  66.92 
 
 
795 aa  1117    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  68.02 
 
 
791 aa  1148    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  66.24 
 
 
794 aa  1117    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  65.39 
 
 
791 aa  1105    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  48.97 
 
 
799 aa  768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  65.73 
 
 
794 aa  1080    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  49.37 
 
 
815 aa  815    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  49.31 
 
 
803 aa  819    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  69.92 
 
 
790 aa  1172    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  63.71 
 
 
779 aa  997    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  74.81 
 
 
792 aa  1252    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  53.24 
 
 
819 aa  863    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  53.99 
 
 
821 aa  878    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
799 aa  1053    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  51.86 
 
 
794 aa  823    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  69.54 
 
 
791 aa  1160    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  55.46 
 
 
798 aa  912    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  63.53 
 
 
800 aa  1046    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  51.83 
 
 
800 aa  843    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6481  phosphoenolpyruvate synthase  51.21 
 
 
811 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237379  normal  0.463412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  66.41 
 
 
796 aa  1087    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  70.3 
 
 
792 aa  1173    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  53.49 
 
 
804 aa  860    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
799 aa  1053    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  54.49 
 
 
838 aa  875    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  63.9 
 
 
795 aa  1080    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  65.78 
 
 
796 aa  1075    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  64.17 
 
 
799 aa  1053    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
789 aa  1625    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  68.49 
 
 
798 aa  1146    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  64.59 
 
 
799 aa  1047    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  63.5 
 
 
789 aa  1038    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  52.34 
 
 
825 aa  827    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  65.74 
 
 
799 aa  1071    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  63.75 
 
 
800 aa  1054    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  92.01 
 
 
791 aa  1499    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  52.96 
 
 
801 aa  863    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  66.88 
 
 
796 aa  1128    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  66.11 
 
 
794 aa  1112    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  64.84 
 
 
794 aa  1062    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  62.47 
 
 
793 aa  1007    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
800 aa  1058    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  53.4 
 
 
798 aa  851    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  96.7 
 
 
789 aa  1560    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  51.65 
 
 
806 aa  802    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  76.81 
 
 
791 aa  1276    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2594  phosphoenolpyruvate synthase  51.52 
 
 
812 aa  832    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  65.86 
 
 
799 aa  1078    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
799 aa  1053    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  67.18 
 
 
795 aa  1123    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  53.34 
 
 
825 aa  883    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  97.84 
 
 
789 aa  1579    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  70.87 
 
 
815 aa  1182    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  90.75 
 
 
808 aa  1479    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  63.53 
 
 
799 aa  1050    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  70.43 
 
 
791 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  73.79 
 
 
792 aa  1230    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  50.82 
 
 
793 aa  800    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
799 aa  1053    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  66.41 
 
 
784 aa  1080    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  65.31 
 
 
805 aa  1066    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  73.91 
 
 
792 aa  1247    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  69.58 
 
 
791 aa  1169    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 
800 aa  1058    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  73.4 
 
 
794 aa  1217    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  63.23 
 
 
801 aa  1049    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  74.81 
 
 
792 aa  1253    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  69.26 
 
 
803 aa  1147    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  97.85 
 
 
789 aa  1580    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  52.46 
 
 
805 aa  853    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  45.24 
 
 
824 aa  641    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  64.92 
 
 
801 aa  1055    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  91.38 
 
 
789 aa  1492    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  89.99 
 
 
789 aa  1463    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  53.4 
 
 
798 aa  851    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  53.65 
 
 
798 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  71.71 
 
 
778 aa  1174    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>