More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1894 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  51.17 
 
 		 867 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  51.81 
 
 		 950 aa  668    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  56.99 
 
 		 873 aa  759    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  55.06 
 
 		 907 aa  738    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  100 
 
 		 971 aa  1890    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  44.97 
 
 		 906 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  42.49 
 
 		 826 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.53 
 
 		 821 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.68 
 
 		 887 aa  361  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.68 
 
 		 887 aa  357  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  32.41 
 
 		 891 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  33.42 
 
 		 866 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  32.02 
 
 		 890 aa  335  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  30.67 
 
 		 868 aa  335  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  30.32 
 
 		 868 aa  332  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  30.21 
 
 		 868 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  30.65 
 
 		 868 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  33.81 
 
 		 865 aa  331  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  30.68 
 
 		 868 aa  330  9e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  30.67 
 
 		 868 aa  326  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  29.99 
 
 		 869 aa  324  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  29.53 
 
 		 869 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  30.18 
 
 		 868 aa  320  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  30.18 
 
 		 868 aa  320  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  30.79 
 
 		 874 aa  319  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  36.07 
 
 		 886 aa  313  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 871 aa  298  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  50 
 
 		 781 aa  296  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.99 
 
 		 903 aa  288  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  51.75 
 
 		 840 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  39.91 
 
 		 870 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  41.75 
 
 		 824 aa  269  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  44.21 
 
 		 782 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.57 
 
 		 891 aa  264  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.66 
 
 		 902 aa  259  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  44.51 
 
 		 799 aa  253  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  50.95 
 
 		 835 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  44.57 
 
 		 780 aa  249  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  43.17 
 
 		 761 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  42.9 
 
 		 762 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  48.55 
 
 		 760 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  46.65 
 
 		 785 aa  243  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  39.64 
 
 		 764 aa  243  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  43.4 
 
 		 762 aa  243  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.94 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 		 754 aa  243  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  30.39 
 
 		 837 aa  243  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  42.04 
 
 		 825 aa  239  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  42.37 
 
 		 758 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  42.48 
 
 		 382 aa  238  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  44.94 
 
 		 788 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  43.83 
 
 		 761 aa  237  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  38.96 
 
 		 758 aa  233  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  38.65 
 
 		 758 aa  232  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  45.71 
 
 		 785 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  44.98 
 
 		 810 aa  232  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  42.39 
 
 		 769 aa  232  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  39.26 
 
 		 758 aa  231  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  42.45 
 
 		 892 aa  231  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  39.61 
 
 		 842 aa  230  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  39.18 
 
 		 758 aa  230  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  39.18 
 
 		 758 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  38.87 
 
 		 758 aa  228  6e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  42.41 
 
 		 809 aa  227  8e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  42.42 
 
 		 798 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  38.08 
 
 		 779 aa  222  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  40.9 
 
 		 832 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  41.72 
 
 		 359 aa  222  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  43.92 
 
 		 803 aa  220  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  43.92 
 
 		 803 aa  220  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  43.7 
 
 		 805 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  41.21 
 
 		 366 aa  218  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  43.15 
 
 		 803 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  38.92 
 
 		 757 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.57 
 
 		 852 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  38.94 
 
 		 837 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  42.86 
 
 		 805 aa  214  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  41.84 
 
 		 819 aa  214  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  41.9 
 
 		 760 aa  214  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  42.04 
 
 		 790 aa  213  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.59 
 
 		 809 aa  213  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 		 794 aa  211  8e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.01 
 
 		 812 aa  210  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  39.6 
 
 		 804 aa  210  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  42.6 
 
 		 793 aa  209  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  41.23 
 
 		 815 aa  209  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  41.09 
 
 		 806 aa  209  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  41.84 
 
 		 789 aa  208  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  39 
 
 		 839 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  39 
 
 		 839 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  43.36 
 
 		 1115 aa  208  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.52 
 
 		 302 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  39.76 
 
 		 795 aa  207  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  43.29 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  41.67 
 
 		 791 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 803 aa  207  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  39.88 
 
 		 825 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  39.66 
 
 		 838 aa  206  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  41.37 
 
 		 790 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  40.18 
 
 		 798 aa  205  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>