More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5551 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  55.61 
 
 
821 aa  742    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  100 
 
 
826 aa  1607    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.75 
 
 
873 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  48.22 
 
 
867 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  45.36 
 
 
907 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  45.16 
 
 
906 aa  605  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.44 
 
 
950 aa  561  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  42.11 
 
 
971 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  32.24 
 
 
890 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  30.34 
 
 
868 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  30.51 
 
 
868 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  30.34 
 
 
868 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  36.6 
 
 
886 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  31.11 
 
 
868 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.78 
 
 
887 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  30.12 
 
 
869 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  29.98 
 
 
868 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  30.13 
 
 
868 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  30.34 
 
 
869 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  32.33 
 
 
891 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  30.99 
 
 
874 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  34.73 
 
 
842 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  29.84 
 
 
868 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  31.43 
 
 
866 aa  359  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 
868 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.81 
 
 
887 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.84 
 
 
903 aa  345  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  29.64 
 
 
871 aa  333  8e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 
837 aa  323  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.5 
 
 
891 aa  297  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  31.68 
 
 
788 aa  251  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.98 
 
 
869 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  36.15 
 
 
870 aa  217  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24 
 
 
868 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  38.13 
 
 
865 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  27.94 
 
 
963 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  39.03 
 
 
782 aa  208  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.3 
 
 
840 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 
781 aa  205  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.28 
 
 
835 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  38.64 
 
 
825 aa  195  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.18 
 
 
971 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.77 
 
 
811 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  37.27 
 
 
769 aa  189  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.91 
 
 
971 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.74 
 
 
975 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  37.15 
 
 
764 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  41.37 
 
 
760 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 
799 aa  181  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 
780 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.42 
 
 
902 aa  177  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  39.31 
 
 
788 aa  177  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  37.31 
 
 
785 aa  177  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.63 
 
 
758 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.91 
 
 
302 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  44.96 
 
 
275 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  35.42 
 
 
758 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  34.8 
 
 
758 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  37.26 
 
 
824 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  37.67 
 
 
761 aa  173  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  38.41 
 
 
785 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  35.29 
 
 
757 aa  173  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  34.8 
 
 
758 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  37.67 
 
 
761 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  39.31 
 
 
892 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  29.15 
 
 
725 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 
758 aa  171  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  38.31 
 
 
382 aa  171  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  33.98 
 
 
758 aa  170  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  34.5 
 
 
779 aa  170  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 
810 aa  169  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.28 
 
 
754 aa  168  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  29.26 
 
 
708 aa  167  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
758 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  38 
 
 
762 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  37.22 
 
 
809 aa  165  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  42.03 
 
 
791 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.86 
 
 
852 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  38 
 
 
762 aa  162  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  36.72 
 
 
364 aa  157  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  36.6 
 
 
359 aa  156  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  34.14 
 
 
805 aa  155  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.02 
 
 
810 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 
809 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.65 
 
 
794 aa  154  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.4 
 
 
386 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.43 
 
 
797 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 
794 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  34.3 
 
 
812 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 
794 aa  149  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  33.13 
 
 
795 aa  149  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.23 
 
 
889 aa  149  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  35.53 
 
 
765 aa  149  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  33.44 
 
 
334 aa  147  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  34.3 
 
 
366 aa  147  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  34.38 
 
 
798 aa  145  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  41.55 
 
 
760 aa  145  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  32.75 
 
 
809 aa  144  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.78 
 
 
884 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  31.69 
 
 
805 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>