More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1185 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.36 
 
 		 835 aa  214  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  40.69 
 
 		 769 aa  211  7e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  38.05 
 
 		 758 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  38.68 
 
 		 758 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  37.85 
 
 		 757 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.78 
 
 		 758 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 		 758 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  39.5 
 
 		 761 aa  195  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  35.4 
 
 		 758 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 		 758 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  37.42 
 
 		 781 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  38.06 
 
 		 825 aa  192  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.19 
 
 		 810 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  39.06 
 
 		 762 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  37.61 
 
 		 824 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  34.16 
 
 		 758 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  37.3 
 
 		 761 aa  188  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.95 
 
 		 887 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  40.19 
 
 		 799 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  43.9 
 
 		 867 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  38.92 
 
 		 788 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  38.34 
 
 		 971 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  38.11 
 
 		 754 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  40.6 
 
 		 780 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  39.62 
 
 		 785 aa  181  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  39.01 
 
 		 762 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.94 
 
 		 873 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  38.61 
 
 		 765 aa  178  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  36.74 
 
 		 779 aa  177  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 		 785 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.46 
 
 		 891 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  44.96 
 
 		 826 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.9 
 
 		 902 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  36.56 
 
 		 891 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.22 
 
 		 887 aa  175  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  40.2 
 
 		 907 aa  175  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  39.22 
 
 		 359 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.01 
 
 		 869 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  38.58 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  35.91 
 
 		 782 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  38.96 
 
 		 760 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 868 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 		 870 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.68 
 
 		 840 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.07 
 
 		 386 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  34.8 
 
 		 764 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  37.74 
 
 		 892 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.54 
 
 		 950 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.45 
 
 		 852 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  35.79 
 
 		 890 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  34.29 
 
 		 868 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  39.23 
 
 		 810 aa  165  8e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  33.44 
 
 		 868 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 		 837 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  40 
 
 		 886 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  35.2 
 
 		 794 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  34.08 
 
 		 868 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  33.44 
 
 		 868 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  33.44 
 
 		 868 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  32.7 
 
 		 868 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  33.44 
 
 		 869 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  37.3 
 
 		 809 aa  159  5e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.39 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  33.02 
 
 		 868 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  36.16 
 
 		 906 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 		 797 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  33.87 
 
 		 812 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  35.8 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  33.44 
 
 		 869 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.28 
 
 		 821 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.19 
 
 		 903 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  41.57 
 
 		 788 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  33.01 
 
 		 866 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 871 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 		 809 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  35.95 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  39.51 
 
 		 414 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  35.5 
 
 		 819 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 798 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  35.87 
 
 		 790 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 		 795 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  35.1 
 
 		 865 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  35.22 
 
 		 796 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  34.22 
 
 		 803 aa  148  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  35.22 
 
 		 796 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  34.51 
 
 		 821 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  37.59 
 
 		 842 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  34.85 
 
 		 789 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  35.22 
 
 		 796 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 789 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  34.12 
 
 		 825 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 789 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 789 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  39.53 
 
 		 791 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 789 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 789 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 789 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  36.81 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 789 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>