More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1622 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 891 aa  1835    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  32.04 
 
 		 907 aa  412  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.29 
 
 		 840 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  31.14 
 
 		 892 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  30.56 
 
 		 891 aa  361  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  30.13 
 
 		 871 aa  357  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.15 
 
 		 873 aa  356  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.36 
 
 		 950 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 		 865 aa  354  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  29.59 
 
 		 874 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.25 
 
 		 903 aa  333  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.95 
 
 		 835 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.59 
 
 		 884 aa  320  9e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  47.99 
 
 		 781 aa  301  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  28.77 
 
 		 826 aa  300  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.43 
 
 		 852 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  45.45 
 
 		 785 aa  290  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  28.62 
 
 		 837 aa  287  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  46.45 
 
 		 780 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  45.48 
 
 		 785 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  45.43 
 
 		 890 aa  281  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  45.83 
 
 		 788 aa  278  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  45.68 
 
 		 782 aa  277  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  43.22 
 
 		 760 aa  277  7e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  44.14 
 
 		 799 aa  277  7e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  44.75 
 
 		 758 aa  273  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  44.27 
 
 		 758 aa  273  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  43.83 
 
 		 758 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.74 
 
 		 868 aa  269  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.4 
 
 		 821 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  43.79 
 
 		 754 aa  268  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  27.81 
 
 		 886 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  43.57 
 
 		 762 aa  266  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  43.57 
 
 		 971 aa  264  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  44.62 
 
 		 764 aa  264  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  44.2 
 
 		 758 aa  263  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  44.9 
 
 		 825 aa  261  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  43.44 
 
 		 761 aa  258  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  43.89 
 
 		 757 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  43.61 
 
 		 758 aa  254  7e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  44.98 
 
 		 769 aa  251  4e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.18 
 
 		 887 aa  251  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  39.02 
 
 		 762 aa  250  9e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  35.85 
 
 		 824 aa  248  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  43.28 
 
 		 758 aa  248  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  43.61 
 
 		 758 aa  247  8e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  41.38 
 
 		 761 aa  245  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  43.65 
 
 		 870 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.32 
 
 		 869 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  26.15 
 
 		 885 aa  241  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  25.93 
 
 		 885 aa  240  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  43.83 
 
 		 779 aa  238  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  41.8 
 
 		 866 aa  235  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  39.38 
 
 		 868 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.84 
 
 		 902 aa  233  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  39.76 
 
 		 868 aa  233  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.31 
 
 		 810 aa  231  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  39.45 
 
 		 868 aa  230  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 		 869 aa  230  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  38.53 
 
 		 868 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  38.53 
 
 		 868 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  41.98 
 
 		 804 aa  227  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  38.77 
 
 		 869 aa  227  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  39.06 
 
 		 868 aa  227  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  39.53 
 
 		 810 aa  226  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  38.44 
 
 		 868 aa  226  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 868 aa  225  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  39.33 
 
 		 809 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  40.58 
 
 		 359 aa  221  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  39.51 
 
 		 871 aa  220  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 		 805 aa  220  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  27.36 
 
 		 854 aa  219  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  42.39 
 
 		 801 aa  218  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 792 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 792 aa  217  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 792 aa  217  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  39.29 
 
 		 792 aa  217  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 792 aa  217  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 792 aa  217  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 792 aa  217  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 792 aa  217  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.58 
 
 		 887 aa  217  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  37.3 
 
 		 794 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.01 
 
 		 302 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  40.87 
 
 		 799 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  39.88 
 
 		 803 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 		 799 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 		 799 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 		 799 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 		 799 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 		 799 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 		 799 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 		 812 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 		 792 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  38.86 
 
 		 810 aa  213  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  40.06 
 
 		 796 aa  213  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  40.12 
 
 		 800 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  40.12 
 
 		 800 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  26.51 
 
 		 842 aa  213  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>