More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4777 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  100 
 
 
821 aa  1614    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  55.73 
 
 
826 aa  777    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  45.04 
 
 
907 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44 
 
 
873 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  43.42 
 
 
906 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  45.9 
 
 
867 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.89 
 
 
950 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  39.92 
 
 
971 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.95 
 
 
887 aa  402  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  41.38 
 
 
886 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  31.07 
 
 
890 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  32.37 
 
 
891 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  29.88 
 
 
868 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.05 
 
 
887 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  28.73 
 
 
868 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  29.68 
 
 
869 aa  366  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  35.69 
 
 
842 aa  366  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  29.4 
 
 
868 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  29.4 
 
 
868 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  29.39 
 
 
869 aa  361  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  33.11 
 
 
870 aa  360  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  28.85 
 
 
868 aa  360  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  28.76 
 
 
868 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  28.24 
 
 
868 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  28.36 
 
 
868 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  32.85 
 
 
865 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  30.71 
 
 
871 aa  349  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  30.01 
 
 
866 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  29.24 
 
 
874 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.26 
 
 
903 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.22 
 
 
840 aa  320  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  31.82 
 
 
837 aa  318  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.37 
 
 
891 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  31.37 
 
 
791 aa  260  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  31.33 
 
 
788 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.88 
 
 
835 aa  231  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.65 
 
 
868 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  38.26 
 
 
781 aa  194  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  36.22 
 
 
782 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.55 
 
 
971 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
785 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.56 
 
 
869 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.43 
 
 
971 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 
788 aa  177  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  36.47 
 
 
799 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.16 
 
 
902 aa  175  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 
780 aa  175  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  35.81 
 
 
892 aa  173  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  32.9 
 
 
825 aa  172  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  39.09 
 
 
760 aa  171  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  42.69 
 
 
275 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  35.13 
 
 
785 aa  168  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.92 
 
 
302 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.47 
 
 
884 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  32.61 
 
 
758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.17 
 
 
852 aa  164  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  35.67 
 
 
359 aa  164  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  33.65 
 
 
761 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  35.53 
 
 
364 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  36.16 
 
 
762 aa  162  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  33.87 
 
 
824 aa  160  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.87 
 
 
386 aa  160  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.37 
 
 
758 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.41 
 
 
810 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  32.91 
 
 
779 aa  160  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 
758 aa  159  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  31.99 
 
 
758 aa  158  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.54 
 
 
754 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  30.89 
 
 
764 aa  157  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.5 
 
 
769 aa  155  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.53 
 
 
889 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  32.06 
 
 
761 aa  154  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  40.2 
 
 
414 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  36.77 
 
 
382 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.11 
 
 
794 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  31.05 
 
 
757 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 
758 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  33.22 
 
 
334 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 
810 aa  149  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  36.51 
 
 
871 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  37.4 
 
 
885 aa  148  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  35.65 
 
 
810 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  35.86 
 
 
708 aa  147  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  35.86 
 
 
725 aa  147  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  29.97 
 
 
758 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 
809 aa  145  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 
809 aa  146  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  37.4 
 
 
885 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  33.94 
 
 
790 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  34.27 
 
 
765 aa  145  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  32.7 
 
 
762 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  30.62 
 
 
758 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  33.44 
 
 
798 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  33.94 
 
 
791 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  31.45 
 
 
812 aa  141  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  34.58 
 
 
366 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  33.94 
 
 
791 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
791 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  33.64 
 
 
791 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  33.94 
 
 
792 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>