More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5062 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  100 
 
 		 840 aa  1671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  50.06 
 
 		 835 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.15 
 
 		 873 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.07 
 
 		 891 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  33.99 
 
 		 892 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  29.99 
 
 		 825 aa  362  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.12 
 
 		 902 aa  351  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  30.53 
 
 		 868 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 866 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  29.88 
 
 		 871 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  31.31 
 
 		 870 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  32.84 
 
 		 865 aa  317  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.65 
 
 		 889 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  32.54 
 
 		 842 aa  291  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.98 
 
 		 821 aa  284  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  51.75 
 
 		 971 aa  280  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  29.95 
 
 		 837 aa  270  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  46.76 
 
 		 907 aa  266  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.18 
 
 		 887 aa  254  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 		 891 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  43.3 
 
 		 781 aa  251  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  30.31 
 
 		 791 aa  251  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.2 
 
 		 887 aa  247  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  43.44 
 
 		 868 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  41.51 
 
 		 868 aa  244  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  32.63 
 
 		 835 aa  244  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 		 868 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  41.82 
 
 		 868 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.11 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  41.88 
 
 		 869 aa  240  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  42.19 
 
 		 868 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  49.69 
 
 		 867 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  40.25 
 
 		 869 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 		 762 aa  233  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  39.87 
 
 		 758 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  42.81 
 
 		 906 aa  231  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.45 
 
 		 903 aa  231  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 		 757 aa  231  6e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  39.87 
 
 		 758 aa  231  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  39.24 
 
 		 758 aa  229  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  40.62 
 
 		 782 aa  229  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.92 
 
 		 868 aa  229  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  40.51 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  43.75 
 
 		 788 aa  228  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  42.64 
 
 		 824 aa  227  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  29.17 
 
 		 788 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 		 769 aa  225  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  43.95 
 
 		 760 aa  225  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 		 890 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  43.83 
 
 		 780 aa  223  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  40.32 
 
 		 764 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.4 
 
 		 302 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  43.73 
 
 		 785 aa  222  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  44.15 
 
 		 785 aa  221  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  40.97 
 
 		 779 aa  221  5e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 		 758 aa  221  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.8 
 
 		 725 aa  220  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  39.5 
 
 		 868 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  38.73 
 
 		 758 aa  220  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  54.75 
 
 		 950 aa  220  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  38.41 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 		 761 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 		 868 aa  218  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  42.99 
 
 		 799 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.93 
 
 		 810 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  42.27 
 
 		 765 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.31 
 
 		 761 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.15 
 
 		 852 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  38.17 
 
 		 754 aa  211  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  38.39 
 
 		 762 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  29.37 
 
 		 854 aa  208  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  39.62 
 
 		 874 aa  208  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  41.43 
 
 		 366 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  41.53 
 
 		 364 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  45.3 
 
 		 826 aa  205  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  42.99 
 
 		 886 aa  205  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  39.56 
 
 		 810 aa  204  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.56 
 
 		 971 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  36.51 
 
 		 794 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.56 
 
 		 812 aa  201  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.43 
 
 		 971 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  36.07 
 
 		 382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.34 
 
 		 975 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.44 
 
 		 797 aa  199  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 		 805 aa  198  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  36.2 
 
 		 793 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 		 812 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 		 809 aa  194  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 760 aa  194  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  38.53 
 
 		 812 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  39 
 
 		 815 aa  188  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  34.95 
 
 		 804 aa  188  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  38.53 
 
 		 798 aa  187  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  37.54 
 
 		 911 aa  185  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  39.67 
 
 		 359 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  38.96 
 
 		 809 aa  184  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 		 803 aa  184  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  39.38 
 
 		 790 aa  184  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  36.86 
 
 		 794 aa  183  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  38.76 
 
 		 800 aa  183  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>