More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4240 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  43.33 
 
 
781 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  41.9 
 
 
782 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.1 
 
 
887 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  42.54 
 
 
825 aa  239  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  39.14 
 
 
764 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  38.63 
 
 
758 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  38.32 
 
 
758 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  40.5 
 
 
758 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 
788 aa  226  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 
758 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  39.94 
 
 
758 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  38.44 
 
 
757 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.4 
 
 
840 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  39.88 
 
 
758 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  40.89 
 
 
780 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  39.03 
 
 
761 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  38.32 
 
 
769 aa  218  7e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
758 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.31 
 
 
887 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  41.31 
 
 
835 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.01 
 
 
891 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  37.62 
 
 
762 aa  216  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  40.71 
 
 
785 aa  215  5.9999999999999996e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  37.2 
 
 
824 aa  215  7e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  39.26 
 
 
799 aa  212  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  40.75 
 
 
866 aa  212  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.33 
 
 
873 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.13 
 
 
869 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 
870 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.7 
 
 
810 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  40.52 
 
 
971 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  37.06 
 
 
761 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  39.06 
 
 
891 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  35.94 
 
 
754 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  38.75 
 
 
868 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  39.24 
 
 
865 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  41.41 
 
 
867 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
868 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
868 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.41 
 
 
950 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  42.14 
 
 
907 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 
868 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  38.41 
 
 
868 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  39.42 
 
 
785 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  36.84 
 
 
382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  37.26 
 
 
760 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  37.78 
 
 
868 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  36.86 
 
 
762 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 
868 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  37.72 
 
 
892 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 
804 aa  198  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 
874 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  36.56 
 
 
869 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.91 
 
 
903 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 
869 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  36.7 
 
 
868 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  36.02 
 
 
890 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  37.95 
 
 
789 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  36.78 
 
 
366 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 
806 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.75 
 
 
852 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  36.47 
 
 
803 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  34.36 
 
 
812 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 
793 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  37.65 
 
 
790 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 
793 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 
786 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  35.31 
 
 
760 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  39.02 
 
 
837 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 
812 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  38.14 
 
 
906 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  33.43 
 
 
810 aa  188  9e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  36.58 
 
 
805 aa  188  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  33.43 
 
 
809 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 
795 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  35.67 
 
 
805 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  34.32 
 
 
806 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  34.69 
 
 
804 aa  185  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  37.95 
 
 
790 aa  185  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.69 
 
 
902 aa  185  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 
779 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  37.57 
 
 
800 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  34.22 
 
 
812 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  37.18 
 
 
886 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  34.51 
 
 
803 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  37.66 
 
 
842 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 
798 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 
825 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  34.71 
 
 
809 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  32.34 
 
 
799 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  35.45 
 
 
801 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  31.91 
 
 
809 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  35.42 
 
 
791 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  36.25 
 
 
787 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
798 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
798 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
798 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  34.83 
 
 
798 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  36 
 
 
784 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>