More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4939 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  59.7 
 
 
868 aa  1127    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  58.85 
 
 
868 aa  1116    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  58.97 
 
 
868 aa  1118    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  58.57 
 
 
869 aa  1100    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  58.8 
 
 
868 aa  1103    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  42.74 
 
 
837 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  55.68 
 
 
871 aa  1006    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  43.48 
 
 
890 aa  721    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  58.53 
 
 
868 aa  1106    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  58.34 
 
 
869 aa  1108    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  63.54 
 
 
842 aa  1063    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  58.85 
 
 
868 aa  1116    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  60.79 
 
 
870 aa  1065    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  59.26 
 
 
868 aa  1111    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
865 aa  1743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  59.54 
 
 
868 aa  1128    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  54.46 
 
 
874 aa  999    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  61.41 
 
 
866 aa  1113    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  38.4 
 
 
891 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.61 
 
 
887 aa  595  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.96 
 
 
903 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.71 
 
 
873 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.92 
 
 
887 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0174  phosphoenolpyruvate synthase  59.81 
 
 
341 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466875  normal  0.4987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.64 
 
 
867 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.34 
 
 
891 aa  343  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  33.07 
 
 
971 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.25 
 
 
821 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  34 
 
 
886 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.36 
 
 
840 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.08 
 
 
869 aa  297  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  26.89 
 
 
825 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  43.75 
 
 
907 aa  276  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.13 
 
 
884 aa  269  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  43.99 
 
 
762 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.13 
 
 
950 aa  251  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  40.95 
 
 
758 aa  250  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  40.19 
 
 
906 aa  246  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.51 
 
 
761 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 
769 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  41.99 
 
 
824 aa  231  5e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  42.9 
 
 
788 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  41.39 
 
 
764 aa  229  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  39.62 
 
 
754 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  40.49 
 
 
782 aa  227  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  41.77 
 
 
762 aa  227  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.93 
 
 
902 aa  224  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.71 
 
 
835 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  38.15 
 
 
781 aa  223  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  40.31 
 
 
761 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  39.21 
 
 
810 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 
758 aa  219  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  38.3 
 
 
809 aa  219  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  42.86 
 
 
785 aa  218  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  37.14 
 
 
758 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  40.99 
 
 
785 aa  216  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  41.4 
 
 
780 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  35.67 
 
 
757 aa  213  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  38.15 
 
 
809 aa  213  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  38.13 
 
 
826 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  36.51 
 
 
758 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 
799 aa  211  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  40.18 
 
 
789 aa  210  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 
789 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 
812 aa  209  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  37.15 
 
 
758 aa  208  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  40.71 
 
 
892 aa  209  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  39.04 
 
 
798 aa  208  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  37.15 
 
 
758 aa  208  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  38.92 
 
 
791 aa  207  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  40.62 
 
 
786 aa  207  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  38.81 
 
 
821 aa  207  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  40.9 
 
 
796 aa  207  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  40.9 
 
 
796 aa  207  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  39.76 
 
 
789 aa  207  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  39.1 
 
 
789 aa  207  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  39.1 
 
 
789 aa  207  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
789 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
789 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  39.52 
 
 
789 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 
789 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
789 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  39.46 
 
 
798 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  39.76 
 
 
789 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  40.3 
 
 
801 aa  206  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.24 
 
 
302 aa  205  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  40.78 
 
 
760 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  39.76 
 
 
797 aa  204  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 
790 aa  204  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  38.67 
 
 
798 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  38.67 
 
 
798 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  38.67 
 
 
798 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  40.06 
 
 
796 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 
758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 
784 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
808 aa  202  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  37.78 
 
 
798 aa  201  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  37.21 
 
 
803 aa  200  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  37.21 
 
 
803 aa  200  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  37.77 
 
 
779 aa  200  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>