More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2649 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  51.58 
 
 
889 aa  902    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  100 
 
 
884 aa  1818    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  35.39 
 
 
854 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  35.18 
 
 
842 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  35.18 
 
 
842 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  36.73 
 
 
725 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  36.01 
 
 
708 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  30.14 
 
 
891 aa  350  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.29 
 
 
891 aa  313  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
890 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  30.37 
 
 
907 aa  299  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.18 
 
 
873 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.57 
 
 
887 aa  292  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  28.27 
 
 
870 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  26.76 
 
 
865 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  28.21 
 
 
868 aa  273  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  28.74 
 
 
868 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  28.51 
 
 
869 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 
868 aa  267  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  28.52 
 
 
868 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  28.11 
 
 
868 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  28.52 
 
 
868 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  27.2 
 
 
866 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  28.62 
 
 
868 aa  263  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  28.29 
 
 
868 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.99 
 
 
869 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 
871 aa  261  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  27.42 
 
 
842 aa  260  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.29 
 
 
835 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.97 
 
 
852 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.56 
 
 
950 aa  253  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.92 
 
 
868 aa  246  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  26.87 
 
 
837 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  24.72 
 
 
885 aa  210  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  25.73 
 
 
788 aa  207  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  39.87 
 
 
781 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  24.22 
 
 
885 aa  202  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  26.2 
 
 
791 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.99 
 
 
971 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.58 
 
 
902 aa  197  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.86 
 
 
971 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  37.26 
 
 
782 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.35 
 
 
975 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  26.15 
 
 
956 aa  187  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.28 
 
 
811 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  37.7 
 
 
892 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  37.54 
 
 
825 aa  180  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  37.9 
 
 
971 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  24.49 
 
 
963 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.74 
 
 
840 aa  170  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.83 
 
 
887 aa  169  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.43 
 
 
959 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  33.55 
 
 
762 aa  163  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.04 
 
 
903 aa  163  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  36.51 
 
 
809 aa  163  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.47 
 
 
821 aa  161  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  32.83 
 
 
761 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  35.28 
 
 
812 aa  160  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  34.01 
 
 
874 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  34.45 
 
 
810 aa  159  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  36.04 
 
 
869 aa  158  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  33.33 
 
 
906 aa  157  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.58 
 
 
810 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  36.02 
 
 
764 aa  156  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 
758 aa  156  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  34.63 
 
 
785 aa  155  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  33.87 
 
 
758 aa  155  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  32.49 
 
 
758 aa  154  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  33.55 
 
 
824 aa  154  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  34.65 
 
 
812 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 
769 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  33.44 
 
 
761 aa  153  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.48 
 
 
302 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  33.65 
 
 
758 aa  154  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  33.43 
 
 
805 aa  152  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  33.87 
 
 
758 aa  152  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.43 
 
 
797 aa  152  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 
758 aa  151  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  34.19 
 
 
809 aa  151  6e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  31.32 
 
 
359 aa  151  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.86 
 
 
758 aa  150  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  32.48 
 
 
382 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  33.83 
 
 
809 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  34.78 
 
 
793 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  33.75 
 
 
754 aa  149  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0682  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  23.99 
 
 
873 aa  148  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  35.41 
 
 
334 aa  147  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 
799 aa  147  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  32.82 
 
 
765 aa  147  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  31.05 
 
 
366 aa  147  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  31.65 
 
 
757 aa  146  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  35.48 
 
 
788 aa  145  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  31.55 
 
 
821 aa  145  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  32.93 
 
 
780 aa  145  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  31.53 
 
 
871 aa  144  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  32.01 
 
 
794 aa  144  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  33.65 
 
 
760 aa  144  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  34.21 
 
 
886 aa  144  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  33.43 
 
 
800 aa  144  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  32.84 
 
 
795 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>