More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0510 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  100 
 
 
334 aa  668    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  48.48 
 
 
809 aa  265  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  47.26 
 
 
809 aa  264  2e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  47.56 
 
 
812 aa  260  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  47.89 
 
 
810 aa  261  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  44.1 
 
 
779 aa  259  6e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  43.8 
 
 
824 aa  255  9e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.45 
 
 
887 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  41.16 
 
 
382 aa  225  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  39.21 
 
 
794 aa  225  8e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  41.98 
 
 
364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  41.23 
 
 
781 aa  209  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 
754 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  38.8 
 
 
757 aa  208  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 
758 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  39.81 
 
 
359 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  38.68 
 
 
758 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.54 
 
 
891 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 
890 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  38.34 
 
 
825 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 
788 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  37.07 
 
 
758 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 
782 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  38.1 
 
 
868 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  37.78 
 
 
874 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  40.61 
 
 
779 aa  198  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  39.32 
 
 
769 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 
868 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 
868 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  39.21 
 
 
790 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 
866 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 
868 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 
790 aa  195  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  38.11 
 
 
805 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  36.86 
 
 
868 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  36.74 
 
 
868 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  36.74 
 
 
868 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  36.1 
 
 
869 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  38.05 
 
 
799 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  38.05 
 
 
799 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  40.79 
 
 
821 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  37.08 
 
 
793 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  37.65 
 
 
801 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  37.25 
 
 
799 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  38.26 
 
 
870 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  36.54 
 
 
758 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  37.61 
 
 
795 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 
785 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  37.32 
 
 
800 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  36.92 
 
 
809 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 
758 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  35.9 
 
 
758 aa  189  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
762 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
800 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
800 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
800 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  35.76 
 
 
758 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  38.79 
 
 
796 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  37.69 
 
 
785 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 
801 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  35.82 
 
 
794 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  38.87 
 
 
791 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  36.31 
 
 
801 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  37.09 
 
 
799 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 
799 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 
799 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  34.39 
 
 
891 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 
869 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.58 
 
 
835 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 
799 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  39.56 
 
 
780 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  37.18 
 
 
865 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 
798 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
800 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 
812 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  36.58 
 
 
791 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  36.16 
 
 
799 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 
799 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  36.26 
 
 
798 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 
799 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 
799 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  36.12 
 
 
794 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 
795 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 
799 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 
799 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 
799 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  36.9 
 
 
789 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  37.03 
 
 
801 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  37.69 
 
 
795 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  35.06 
 
 
812 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  36.64 
 
 
803 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  36.61 
 
 
795 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  36.61 
 
 
789 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 
797 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 
764 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  37.96 
 
 
814 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  40.06 
 
 
792 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  35.89 
 
 
799 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 
796 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  36.72 
 
 
789 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>