More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2960 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  63.52 
 
 		 869 aa  1169    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  65.32 
 
 		 868 aa  1196    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  64.52 
 
 		 868 aa  1184    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  64.29 
 
 		 868 aa  1185    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  64.56 
 
 		 869 aa  1167    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  55.22 
 
 		 871 aa  980    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  43.32 
 
 		 890 aa  726    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  64.52 
 
 		 868 aa  1174    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  43.59 
 
 		 837 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  63.59 
 
 		 868 aa  1165    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  64.52 
 
 		 868 aa  1184    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  53.36 
 
 		 842 aa  957    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 866 aa  1784    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  61.18 
 
 		 865 aa  1104    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  58.24 
 
 		 874 aa  1061    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  63.82 
 
 		 868 aa  1167    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  57.72 
 
 		 870 aa  1044    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  65.21 
 
 		 868 aa  1176    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.6 
 
 		 887 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  39.02 
 
 		 891 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.71 
 
 		 903 aa  484  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.14 
 
 		 873 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.64 
 
 		 887 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  34.94 
 
 		 907 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.49 
 
 		 950 aa  415  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0174  phosphoenolpyruvate synthase  58.7 
 
 		 341 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466875  normal  0.4987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  33.08 
 
 		 906 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.71 
 
 		 867 aa  365  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  31.14 
 
 		 826 aa  350  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  30.79 
 
 		 886 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  33.21 
 
 		 971 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.63 
 
 		 869 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.86 
 
 		 840 aa  321  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.82 
 
 		 821 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.2 
 
 		 884 aa  266  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  42.09 
 
 		 758 aa  250  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  42.02 
 
 		 781 aa  244  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  40.31 
 
 		 754 aa  240  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  41.67 
 
 		 824 aa  239  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  41.08 
 
 		 762 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 		 782 aa  235  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.8 
 
 		 891 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  41.32 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.01 
 
 		 852 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  40.38 
 
 		 788 aa  227  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.52 
 
 		 902 aa  226  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  41.72 
 
 		 762 aa  226  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  38.4 
 
 		 892 aa  225  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  41.08 
 
 		 780 aa  225  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  40.45 
 
 		 785 aa  224  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  40.18 
 
 		 764 aa  224  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  38.34 
 
 		 809 aa  221  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 		 758 aa  221  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  35.46 
 
 		 825 aa  221  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  40.45 
 
 		 785 aa  220  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  39.18 
 
 		 769 aa  220  8.999999999999998e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 		 758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  37.74 
 
 		 757 aa  218  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  41.3 
 
 		 835 aa  218  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  40.66 
 
 		 798 aa  217  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 		 761 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  37.8 
 
 		 812 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 		 799 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  36.48 
 
 		 758 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  36.53 
 
 		 758 aa  214  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  37.73 
 
 		 810 aa  213  9e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  33.49 
 
 		 786 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.75 
 
 		 302 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  35.03 
 
 		 758 aa  212  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 		 809 aa  212  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 		 795 aa  210  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 		 760 aa  210  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  38.81 
 
 		 796 aa  209  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  36.92 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  38.81 
 
 		 796 aa  209  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  39.13 
 
 		 805 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  38.51 
 
 		 364 aa  207  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  36.57 
 
 		 798 aa  207  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  38.74 
 
 		 794 aa  207  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  37.84 
 
 		 798 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  37.84 
 
 		 798 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  37.84 
 
 		 798 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  36.75 
 
 		 801 aa  206  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  39.05 
 
 		 821 aa  206  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  36.72 
 
 		 791 aa  205  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  37.57 
 
 		 1115 aa  204  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 		 796 aa  205  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 		 801 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 		 800 aa  204  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 		 803 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 		 803 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  37.72 
 
 		 790 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  38.21 
 
 		 789 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  37.61 
 
 		 796 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 		 810 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  38.24 
 
 		 806 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  38.48 
 
 		 794 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 		 793 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 		 803 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  37.13 
 
 		 791 aa  201  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>