More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5613 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  52.93 
 
 
867 aa  755    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  100 
 
 
873 aa  1732    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  54.83 
 
 
950 aa  862    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  55.78 
 
 
907 aa  868    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  48.48 
 
 
906 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  56.97 
 
 
971 aa  735    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  45.68 
 
 
826 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  43.66 
 
 
821 aa  558  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  34.8 
 
 
868 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  34.87 
 
 
868 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  34.59 
 
 
868 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  34.7 
 
 
868 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  34.87 
 
 
868 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  34.87 
 
 
868 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  35.75 
 
 
891 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  34.29 
 
 
869 aa  465  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  34.14 
 
 
869 aa  466  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  34.5 
 
 
868 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.8 
 
 
887 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  33.66 
 
 
868 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 
866 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  37.71 
 
 
865 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  33.96 
 
 
890 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  35.05 
 
 
874 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  35.37 
 
 
870 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  36.81 
 
 
886 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  33.99 
 
 
871 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  36.71 
 
 
842 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.54 
 
 
887 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.01 
 
 
903 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.03 
 
 
840 aa  386  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.85 
 
 
891 aa  350  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  32.14 
 
 
837 aa  345  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.55 
 
 
902 aa  317  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.18 
 
 
884 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  29.87 
 
 
885 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  46.69 
 
 
781 aa  260  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  29.15 
 
 
885 aa  257  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  49.35 
 
 
835 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  29.48 
 
 
854 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 
782 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.26 
 
 
869 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  42.64 
 
 
824 aa  237  7e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.77 
 
 
797 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  43.03 
 
 
769 aa  230  7e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  44.18 
 
 
785 aa  229  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  41.74 
 
 
754 aa  228  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  45.57 
 
 
788 aa  227  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  40.43 
 
 
825 aa  227  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  43.88 
 
 
785 aa  226  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  44.59 
 
 
780 aa  225  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  36.47 
 
 
764 aa  225  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  42.41 
 
 
799 aa  224  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  38.95 
 
 
779 aa  223  9e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  43.4 
 
 
761 aa  221  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  44.03 
 
 
762 aa  221  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  41.46 
 
 
758 aa  220  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  41.46 
 
 
758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  42.01 
 
 
810 aa  217  8e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  40.63 
 
 
758 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  41.23 
 
 
892 aa  214  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.48 
 
 
761 aa  214  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  40.57 
 
 
757 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.64 
 
 
852 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.33 
 
 
302 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  32.41 
 
 
725 aa  213  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  40.95 
 
 
758 aa  213  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  39.01 
 
 
760 aa  211  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  42.73 
 
 
793 aa  211  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  42.22 
 
 
798 aa  210  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  41.4 
 
 
762 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  43.27 
 
 
760 aa  208  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 
809 aa  208  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  32.39 
 
 
708 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.08 
 
 
868 aa  204  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  42.57 
 
 
1115 aa  204  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  42.02 
 
 
382 aa  204  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  41.69 
 
 
790 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  39.35 
 
 
359 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.33 
 
 
810 aa  202  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  41.09 
 
 
791 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  41.09 
 
 
791 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  41.99 
 
 
790 aa  200  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  41.09 
 
 
791 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  41.99 
 
 
792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  40.61 
 
 
791 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  40.84 
 
 
805 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  40.79 
 
 
791 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  37.84 
 
 
798 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  37.84 
 
 
798 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  37.84 
 
 
798 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.75 
 
 
809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 
794 aa  198  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 
758 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  41.69 
 
 
791 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  41.9 
 
 
765 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  40.79 
 
 
791 aa  197  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  42.99 
 
 
804 aa  197  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  38.87 
 
 
812 aa  196  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  40.18 
 
 
791 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>