More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0605 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  52.08 
 
 
971 aa  835    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
950 aa  1847    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  55.15 
 
 
873 aa  873    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  53.53 
 
 
867 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  60.92 
 
 
907 aa  1027    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  49.84 
 
 
906 aa  763    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  45.56 
 
 
826 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44.67 
 
 
821 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  35.49 
 
 
891 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.44 
 
 
887 aa  449  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  32.8 
 
 
890 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  35.34 
 
 
865 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  31.53 
 
 
868 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  31.35 
 
 
868 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  34.25 
 
 
866 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  32 
 
 
869 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  32.42 
 
 
868 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  32.42 
 
 
868 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  32.77 
 
 
871 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  32.56 
 
 
874 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 
869 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  31.2 
 
 
868 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  33.3 
 
 
870 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  37.41 
 
 
886 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  35.36 
 
 
842 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.36 
 
 
887 aa  386  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.67 
 
 
891 aa  352  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.05 
 
 
902 aa  347  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 
837 aa  333  9e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.68 
 
 
889 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.08 
 
 
884 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  35.96 
 
 
868 aa  262  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  44.14 
 
 
781 aa  260  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  36.53 
 
 
868 aa  255  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.02 
 
 
840 aa  248  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 
782 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.56 
 
 
835 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  36.6 
 
 
868 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  43.75 
 
 
869 aa  240  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  40 
 
 
825 aa  239  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  42.26 
 
 
824 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  44.3 
 
 
892 aa  230  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  39.71 
 
 
754 aa  228  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  40.27 
 
 
762 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  39.23 
 
 
764 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 
761 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 
761 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  37.96 
 
 
758 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  33.88 
 
 
794 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  40.1 
 
 
789 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 
788 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  40.9 
 
 
1115 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  38.64 
 
 
769 aa  214  9e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  40.55 
 
 
762 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 
785 aa  213  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  34.85 
 
 
779 aa  212  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  38.26 
 
 
809 aa  211  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.1 
 
 
903 aa  211  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.66 
 
 
809 aa  211  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.81 
 
 
810 aa  211  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  38.84 
 
 
810 aa  211  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  42.26 
 
 
760 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  39.9 
 
 
786 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  42.09 
 
 
366 aa  209  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.71 
 
 
302 aa  209  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  39.56 
 
 
791 aa  208  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 
757 aa  208  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  39.56 
 
 
791 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  39.08 
 
 
803 aa  206  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 
758 aa  206  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.93 
 
 
852 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  40.38 
 
 
791 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  40.38 
 
 
791 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  38.55 
 
 
798 aa  204  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 
805 aa  204  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  38.75 
 
 
799 aa  204  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  36.56 
 
 
758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  39.01 
 
 
791 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 
780 aa  202  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
798 aa  202  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
798 aa  202  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  39.89 
 
 
790 aa  202  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  37.6 
 
 
364 aa  202  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
798 aa  202  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  40.11 
 
 
791 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  38.52 
 
 
790 aa  201  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  40.92 
 
 
803 aa  201  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  40.92 
 
 
803 aa  201  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  38.67 
 
 
815 aa  201  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  34.94 
 
 
758 aa  201  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  39.84 
 
 
791 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 
758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  34.94 
 
 
758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  35.54 
 
 
791 aa  198  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  39.76 
 
 
785 aa  199  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  35.98 
 
 
758 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  39.95 
 
 
796 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  41.69 
 
 
793 aa  197  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  35.55 
 
 
790 aa  197  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  41.27 
 
 
810 aa  197  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>