More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0349 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  100 
 
 		 825 aa  1711    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.22 
 
 		 840 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.88 
 
 		 835 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  28.96 
 
 		 869 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  28.16 
 
 		 874 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 		 868 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  28.6 
 
 		 891 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  27.01 
 
 		 865 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  48.09 
 
 		 762 aa  280  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  47.98 
 
 		 781 aa  271  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  28.31 
 
 		 837 aa  271  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  47.04 
 
 		 769 aa  269  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  45.81 
 
 		 799 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  44.81 
 
 		 764 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  45.05 
 
 		 761 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  46.39 
 
 		 780 aa  263  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  46.01 
 
 		 761 aa  263  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.9 
 
 		 891 aa  261  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  44.31 
 
 		 757 aa  260  8e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  46.52 
 
 		 785 aa  260  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  44.79 
 
 		 754 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  43.44 
 
 		 758 aa  258  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  45.62 
 
 		 785 aa  257  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  43.81 
 
 		 824 aa  256  9e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  41.49 
 
 		 758 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  45.4 
 
 		 762 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  41.18 
 
 		 758 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.99 
 
 		 869 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  45 
 
 		 782 aa  253  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 790 aa  252  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  42.21 
 
 		 791 aa  252  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  41.67 
 
 		 758 aa  251  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  42.47 
 
 		 907 aa  251  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  42.95 
 
 		 788 aa  251  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  41.36 
 
 		 758 aa  250  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  44.28 
 
 		 758 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  44.22 
 
 		 805 aa  249  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  41.05 
 
 		 758 aa  248  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 789 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 789 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  43.02 
 
 		 789 aa  248  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 789 aa  248  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 789 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 789 aa  247  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 789 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 789 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 789 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  26.87 
 
 		 842 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.35 
 
 		 887 aa  246  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  41.16 
 
 		 791 aa  245  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  41.86 
 
 		 789 aa  245  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  43.93 
 
 		 801 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  44.74 
 
 		 760 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  40.4 
 
 		 790 aa  244  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  40.68 
 
 		 791 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 808 aa  244  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 790 aa  243  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  44.13 
 
 		 795 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  40.68 
 
 		 792 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  43.84 
 
 		 795 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  43.58 
 
 		 792 aa  243  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 		 892 aa  243  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  42.03 
 
 		 794 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  40.99 
 
 		 789 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  43.79 
 
 		 382 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  39.83 
 
 		 791 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  41.86 
 
 		 789 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  39.83 
 
 		 791 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  41.29 
 
 		 795 aa  240  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.54 
 
 		 302 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  42.41 
 
 		 790 aa  240  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  41.74 
 
 		 815 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  42.04 
 
 		 971 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  41.1 
 
 		 868 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  43.03 
 
 		 798 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  42.45 
 
 		 792 aa  238  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  39.55 
 
 		 791 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  42.17 
 
 		 796 aa  238  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  39.83 
 
 		 791 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  42.09 
 
 		 792 aa  238  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  41.99 
 
 		 810 aa  238  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 791 aa  237  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  43.27 
 
 		 795 aa  237  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  40.92 
 
 		 868 aa  237  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 794 aa  237  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 791 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  42.64 
 
 		 795 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  44.04 
 
 		 790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  42.56 
 
 		 789 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  41.79 
 
 		 792 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  41.27 
 
 		 792 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  42.69 
 
 		 794 aa  235  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  41.27 
 
 		 792 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  41.27 
 
 		 792 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  41.27 
 
 		 792 aa  235  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  41.27 
 
 		 792 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  41.03 
 
 		 868 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  41.45 
 
 		 795 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  41.27 
 
 		 792 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>