More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2573 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  100 
 
 
835 aa  1612    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  50.25 
 
 
840 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  30.7 
 
 
825 aa  382  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  32.45 
 
 
891 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.64 
 
 
873 aa  364  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.2 
 
 
891 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  29.14 
 
 
868 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  29.14 
 
 
868 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  28.4 
 
 
868 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  28.88 
 
 
868 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  28.67 
 
 
868 aa  314  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  28.65 
 
 
868 aa  313  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  28.7 
 
 
868 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  28.16 
 
 
868 aa  300  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.62 
 
 
884 aa  290  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  34.64 
 
 
826 aa  289  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 
842 aa  280  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  50.63 
 
 
971 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  39.89 
 
 
890 aa  253  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  42.31 
 
 
870 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.68 
 
 
887 aa  250  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  48.28 
 
 
950 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  50.79 
 
 
867 aa  243  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  42.32 
 
 
769 aa  243  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  47.62 
 
 
907 aa  243  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  43.43 
 
 
824 aa  242  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  49.53 
 
 
902 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  47.59 
 
 
892 aa  241  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.05 
 
 
887 aa  240  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  40.19 
 
 
758 aa  237  7e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  40.19 
 
 
758 aa  237  7e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.28 
 
 
869 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  40.31 
 
 
869 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  40.81 
 
 
758 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  42.71 
 
 
865 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  44.95 
 
 
810 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  39.51 
 
 
869 aa  234  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  40.99 
 
 
781 aa  233  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  39.4 
 
 
761 aa  233  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  44.75 
 
 
906 aa  229  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  41.3 
 
 
866 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  37.65 
 
 
758 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.31 
 
 
302 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 
779 aa  223  9e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  39.48 
 
 
758 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  44.87 
 
 
788 aa  223  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  46.03 
 
 
275 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.69 
 
 
903 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 
758 aa  220  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  38.64 
 
 
757 aa  220  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  41.8 
 
 
799 aa  220  8.999999999999998e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  38.83 
 
 
758 aa  220  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  41.25 
 
 
762 aa  219  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  39.75 
 
 
754 aa  219  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  41.25 
 
 
874 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  42.39 
 
 
785 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  41.54 
 
 
382 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  42.72 
 
 
780 aa  217  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  44.26 
 
 
359 aa  217  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  41.75 
 
 
785 aa  215  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  38.12 
 
 
871 aa  214  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  41.23 
 
 
810 aa  213  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 
782 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  37.97 
 
 
761 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.87 
 
 
809 aa  211  6e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  41.5 
 
 
760 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  41.54 
 
 
364 aa  208  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  37.08 
 
 
812 aa  207  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  38.1 
 
 
762 aa  207  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  37.73 
 
 
809 aa  207  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.46 
 
 
852 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  40.35 
 
 
798 aa  206  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  43.12 
 
 
804 aa  205  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  40.65 
 
 
815 aa  205  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  37.85 
 
 
794 aa  204  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  29.66 
 
 
788 aa  204  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 
794 aa  203  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.53 
 
 
821 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  44.38 
 
 
886 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  40.73 
 
 
790 aa  202  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  37.28 
 
 
790 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  38.22 
 
 
764 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 
793 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  42.41 
 
 
786 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  38.18 
 
 
805 aa  198  3e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  36.9 
 
 
803 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  40.6 
 
 
790 aa  198  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  38.05 
 
 
812 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  37.64 
 
 
789 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  38.33 
 
 
789 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  38.33 
 
 
789 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  38.33 
 
 
789 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  38.33 
 
 
789 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  37.24 
 
 
795 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  40.12 
 
 
791 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  41.9 
 
 
805 aa  197  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  39.1 
 
 
797 aa  197  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  38.04 
 
 
789 aa  197  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  37.36 
 
 
789 aa  197  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>