More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0474 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  49.23 
 
 		 950 aa  774    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.48 
 
 		 873 aa  735    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  49.17 
 
 		 867 aa  704    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  52.52 
 
 		 907 aa  825    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 906 aa  1788    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  45.38 
 
 		 826 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.77 
 
 		 821 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  44.72 
 
 		 971 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  34.05 
 
 		 890 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.27 
 
 		 887 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  31.74 
 
 		 868 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 891 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  31.65 
 
 		 868 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  30.89 
 
 		 869 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  31.65 
 
 		 868 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  37.72 
 
 		 886 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  31.4 
 
 		 868 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  31.32 
 
 		 868 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  31.38 
 
 		 868 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  31.28 
 
 		 868 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  31.25 
 
 		 869 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  30.72 
 
 		 868 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  33.3 
 
 		 866 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  29.98 
 
 		 874 aa  366  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.89 
 
 		 887 aa  361  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  30.6 
 
 		 871 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.26 
 
 		 903 aa  353  7e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  32.28 
 
 		 837 aa  327  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.92 
 
 		 902 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  40.19 
 
 		 865 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  29.87 
 
 		 842 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  29.87 
 
 		 842 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  31.22 
 
 		 788 aa  238  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.81 
 
 		 840 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  37.36 
 
 		 870 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 		 842 aa  225  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44.75 
 
 		 835 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.39 
 
 		 869 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  39.35 
 
 		 781 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.65 
 
 		 811 aa  206  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  39.51 
 
 		 799 aa  200  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  36.39 
 
 		 782 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  39.24 
 
 		 780 aa  197  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  35.06 
 
 		 825 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  35.84 
 
 		 769 aa  196  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.82 
 
 		 754 aa  196  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 		 761 aa  194  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  35.19 
 
 		 824 aa  194  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  37.67 
 
 		 892 aa  193  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  38.44 
 
 		 364 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.92 
 
 		 891 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  36.78 
 
 		 762 aa  191  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  38.26 
 
 		 785 aa  190  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 758 aa  190  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  35 
 
 		 382 aa  190  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 		 761 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.14 
 
 		 302 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  32.66 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  33.94 
 
 		 758 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  32.08 
 
 		 758 aa  184  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  35.26 
 
 		 762 aa  183  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 		 788 aa  181  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  32.29 
 
 		 758 aa  180  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.34 
 
 		 852 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 757 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 		 785 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  34.15 
 
 		 810 aa  174  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  38.14 
 
 		 786 aa  174  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  38.44 
 
 		 760 aa  174  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  32.34 
 
 		 758 aa  173  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  36.11 
 
 		 359 aa  173  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 		 765 aa  173  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.75 
 
 		 810 aa  172  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  32.18 
 
 		 779 aa  171  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 760 aa  167  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  39.88 
 
 		 871 aa  167  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  38.82 
 
 		 810 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  31.4 
 
 		 809 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  34.3 
 
 		 795 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  34.88 
 
 		 791 aa  164  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.43 
 
 		 884 aa  164  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 809 aa  163  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  35.55 
 
 		 791 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  35.12 
 
 		 790 aa  163  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  34.49 
 
 		 795 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  35.47 
 
 		 790 aa  163  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  35.55 
 
 		 792 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.74 
 
 		 889 aa  161  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  33.81 
 
 		 1115 aa  161  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  33.93 
 
 		 798 aa  160  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  32.94 
 
 		 794 aa  160  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  32.65 
 
 		 794 aa  160  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  36.09 
 
 		 366 aa  160  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  34.88 
 
 		 790 aa  160  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  34.59 
 
 		 791 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  34.59 
 
 		 791 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  32.64 
 
 		 812 aa  159  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 791 aa  159  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>