More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3844 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  51.58 
 
 
884 aa  917    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  100 
 
 
889 aa  1833    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  35.73 
 
 
842 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  35.73 
 
 
842 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  34.15 
 
 
854 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  33.8 
 
 
725 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  33.43 
 
 
708 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.65 
 
 
840 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  29.52 
 
 
891 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  28.71 
 
 
870 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.71 
 
 
903 aa  275  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.88 
 
 
950 aa  273  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  27.87 
 
 
874 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 
837 aa  259  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.11 
 
 
891 aa  258  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  27.16 
 
 
842 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.65 
 
 
869 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.49 
 
 
852 aa  247  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  26.79 
 
 
868 aa  237  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.28 
 
 
868 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  27.6 
 
 
791 aa  220  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  25.16 
 
 
885 aa  211  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  24.86 
 
 
885 aa  206  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  27.5 
 
 
788 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.58 
 
 
971 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.83 
 
 
971 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.03 
 
 
902 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  26.22 
 
 
956 aa  189  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.74 
 
 
963 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.74 
 
 
810 aa  184  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.75 
 
 
975 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  34.85 
 
 
781 aa  181  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.2 
 
 
887 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  36.07 
 
 
892 aa  180  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  35.24 
 
 
825 aa  176  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.69 
 
 
835 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  34.37 
 
 
809 aa  171  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 
812 aa  171  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  32.68 
 
 
890 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.92 
 
 
959 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  35.13 
 
 
758 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 
782 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  35.9 
 
 
907 aa  168  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  34.81 
 
 
758 aa  168  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  36.42 
 
 
971 aa  168  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.33 
 
 
887 aa  168  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  34.81 
 
 
758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 
769 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.27 
 
 
873 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 
810 aa  164  9e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  34.18 
 
 
757 aa  164  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  32.34 
 
 
758 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0682  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  25.85 
 
 
873 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  33.43 
 
 
794 aa  160  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  32.1 
 
 
809 aa  159  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  34.28 
 
 
760 aa  158  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.85 
 
 
758 aa  158  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  34.07 
 
 
871 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  34.56 
 
 
865 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  33.53 
 
 
765 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  34.43 
 
 
906 aa  157  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  34.15 
 
 
366 aa  157  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  34.5 
 
 
866 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  34.9 
 
 
809 aa  156  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  31.85 
 
 
758 aa  156  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  24.01 
 
 
1097 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  32.85 
 
 
805 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  32.57 
 
 
794 aa  154  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  34.32 
 
 
812 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.23 
 
 
867 aa  153  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  34.14 
 
 
868 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.53 
 
 
821 aa  153  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.81 
 
 
302 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  31.8 
 
 
779 aa  152  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  30.4 
 
 
824 aa  151  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 
868 aa  150  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 
868 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 
868 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  33.13 
 
 
806 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  32.32 
 
 
808 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  33.85 
 
 
334 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.25 
 
 
794 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  32.64 
 
 
764 aa  149  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 
758 aa  149  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 
868 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  33.01 
 
 
761 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  29.1 
 
 
868 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  32.82 
 
 
793 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  28.72 
 
 
868 aa  147  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  33.9 
 
 
795 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  32.57 
 
 
789 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 
795 aa  147  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  32.57 
 
 
789 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  32.57 
 
 
789 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  31.06 
 
 
761 aa  147  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 
789 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  33.24 
 
 
795 aa  146  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  29.79 
 
 
762 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  32.95 
 
 
812 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  29.02 
 
 
869 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>