More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3615 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
902 aa  1793    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  67.86 
 
 
892 aa  1160    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 
871 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  35.75 
 
 
907 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.12 
 
 
950 aa  343  8e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.9 
 
 
840 aa  339  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  29.47 
 
 
891 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.33 
 
 
873 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  32.61 
 
 
906 aa  292  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.74 
 
 
891 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.59 
 
 
869 aa  277  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.59 
 
 
887 aa  262  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  42.46 
 
 
762 aa  248  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  42.59 
 
 
781 aa  247  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 
761 aa  247  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  32.78 
 
 
971 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.57 
 
 
852 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  40.44 
 
 
757 aa  237  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  40.99 
 
 
758 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  49.53 
 
 
835 aa  235  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  41.3 
 
 
758 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  40.84 
 
 
810 aa  234  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  44.9 
 
 
785 aa  234  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  42.36 
 
 
824 aa  234  6e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  41.32 
 
 
761 aa  234  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  40.92 
 
 
825 aa  233  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.46 
 
 
903 aa  232  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  40.68 
 
 
758 aa  230  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 
782 aa  229  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  40.46 
 
 
779 aa  228  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  40.62 
 
 
754 aa  228  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  40.44 
 
 
758 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  36.91 
 
 
890 aa  227  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  45 
 
 
788 aa  228  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  43.67 
 
 
780 aa  227  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  43.52 
 
 
866 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  29.6 
 
 
791 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  44.9 
 
 
760 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  41.93 
 
 
865 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  38.77 
 
 
809 aa  224  4e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 
799 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 
769 aa  221  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.08 
 
 
812 aa  220  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  44.57 
 
 
867 aa  220  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  42.59 
 
 
785 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.73 
 
 
887 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  39.75 
 
 
762 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  41.11 
 
 
870 aa  214  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  41.54 
 
 
366 aa  214  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 
868 aa  213  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  39.2 
 
 
809 aa  211  4e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 
868 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  37.1 
 
 
869 aa  211  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  36.71 
 
 
869 aa  210  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  37.57 
 
 
871 aa  208  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  39.94 
 
 
359 aa  208  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  36.81 
 
 
868 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  36.52 
 
 
868 aa  206  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  35.76 
 
 
868 aa  206  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  37.73 
 
 
874 aa  205  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  37.1 
 
 
868 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  37.1 
 
 
868 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  41.42 
 
 
382 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  37.79 
 
 
794 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  29.63 
 
 
788 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  35.65 
 
 
868 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.58 
 
 
884 aa  197  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  41.93 
 
 
886 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.57 
 
 
758 aa  196  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  36.5 
 
 
764 aa  193  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  35.19 
 
 
758 aa  193  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  34.45 
 
 
758 aa  193  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.32 
 
 
810 aa  192  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  36.6 
 
 
798 aa  190  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  41.72 
 
 
803 aa  190  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  41.1 
 
 
364 aa  190  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  36.68 
 
 
791 aa  190  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  35.88 
 
 
800 aa  190  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  35.23 
 
 
806 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  37.25 
 
 
798 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  37.25 
 
 
798 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  37.25 
 
 
798 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  34.58 
 
 
793 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 
803 aa  189  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  34.99 
 
 
809 aa  188  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  35.34 
 
 
794 aa  188  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  36.08 
 
 
805 aa  188  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  36.26 
 
 
806 aa  188  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.75 
 
 
889 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  38.44 
 
 
765 aa  187  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  34.94 
 
 
803 aa  187  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  36.1 
 
 
791 aa  187  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  36.16 
 
 
805 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 
805 aa  186  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  35.82 
 
 
791 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.69 
 
 
302 aa  186  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  35.82 
 
 
791 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 
800 aa  185  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  38.04 
 
 
804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  33.96 
 
 
821 aa  184  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>