More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1605 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  100 
 
 		 364 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  48.49 
 
 		 359 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  48.83 
 
 		 824 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  44.04 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  45.91 
 
 		 812 aa  265  1e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  43.81 
 
 		 810 aa  259  6e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  45.77 
 
 		 809 aa  258  9e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  42.9 
 
 		 809 aa  255  6e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  43.13 
 
 		 779 aa  254  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  44.09 
 
 		 796 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  44.09 
 
 		 796 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  42.69 
 
 		 754 aa  242  6e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  40.44 
 
 		 794 aa  242  9e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 		 782 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  42.7 
 
 		 796 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  42.61 
 
 		 796 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  43.31 
 
 		 815 aa  239  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 		 764 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  40.72 
 
 		 366 aa  239  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  40.66 
 
 		 758 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  41.76 
 
 		 812 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  42.78 
 
 		 797 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  39.76 
 
 		 758 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  41.86 
 
 		 789 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  39.33 
 
 		 801 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  43.6 
 
 		 810 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  40.11 
 
 		 803 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  40.3 
 
 		 758 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  38.77 
 
 		 781 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  40.83 
 
 		 798 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  42.23 
 
 		 800 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  40.7 
 
 		 786 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 		 801 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  42.35 
 
 		 794 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 		 800 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  39.71 
 
 		 791 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 		 808 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  42.41 
 
 		 762 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  40.97 
 
 		 801 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.44 
 
 		 761 aa  229  8e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  42.06 
 
 		 795 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 		 801 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  40.11 
 
 		 789 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  41.57 
 
 		 798 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  40.76 
 
 		 799 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  41.23 
 
 		 795 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  39.54 
 
 		 789 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  42.11 
 
 		 799 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  42.11 
 
 		 799 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  39.54 
 
 		 789 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  41.03 
 
 		 799 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  40.4 
 
 		 806 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  39.37 
 
 		 789 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  41.23 
 
 		 795 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 		 799 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  38.2 
 
 		 868 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  40.06 
 
 		 805 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 		 800 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 		 800 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 		 800 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 		 799 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  40.33 
 
 		 812 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 		 799 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 		 799 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 		 799 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 		 799 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  40.68 
 
 		 799 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 		 799 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 		 799 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  39.37 
 
 		 789 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  39.66 
 
 		 789 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  39.37 
 
 		 789 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  39.37 
 
 		 789 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 		 784 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  38.98 
 
 		 789 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  38.31 
 
 		 791 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  42.06 
 
 		 794 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  44.41 
 
 		 779 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  36.9 
 
 		 805 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  39.24 
 
 		 795 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  38.84 
 
 		 795 aa  222  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 		 794 aa  222  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  39.64 
 
 		 795 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  41.23 
 
 		 778 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  41.96 
 
 		 788 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  39.24 
 
 		 790 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  41.98 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  39.64 
 
 		 795 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  41.94 
 
 		 790 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  39.27 
 
 		 800 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  39.66 
 
 		 793 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  39.83 
 
 		 792 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  37.92 
 
 		 789 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  40.06 
 
 		 792 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  39.54 
 
 		 792 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  41.67 
 
 		 795 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  37.78 
 
 		 794 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  39.07 
 
 		 789 aa  219  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  38.26 
 
 		 821 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  40.53 
 
 		 787 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>