More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1117 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  40.8 
 
 
868 aa  661    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  41.02 
 
 
868 aa  659    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  40.8 
 
 
868 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  40.64 
 
 
868 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  41.24 
 
 
868 aa  659    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  42.06 
 
 
890 aa  689    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  41.02 
 
 
868 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  40.35 
 
 
869 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
891 aa  1827    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  40.77 
 
 
868 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 
869 aa  633  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 
868 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  40.42 
 
 
874 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  38.4 
 
 
865 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  39.02 
 
 
866 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38 
 
 
887 aa  581  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  37.56 
 
 
870 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  36.21 
 
 
871 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  35.14 
 
 
842 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  36.63 
 
 
837 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  35.84 
 
 
907 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.13 
 
 
903 aa  488  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.75 
 
 
873 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.49 
 
 
950 aa  469  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.86 
 
 
887 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.88 
 
 
867 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  32.83 
 
 
906 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  32.33 
 
 
826 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.27 
 
 
891 aa  355  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.41 
 
 
884 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.34 
 
 
821 aa  352  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  32.4 
 
 
971 aa  348  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.57 
 
 
902 aa  336  9e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.61 
 
 
835 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.02 
 
 
869 aa  319  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.29 
 
 
889 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  28.76 
 
 
886 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  28.56 
 
 
825 aa  284  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  43.84 
 
 
781 aa  268  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  43.71 
 
 
758 aa  257  7e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  42.34 
 
 
782 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44.3 
 
 
840 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  41.49 
 
 
754 aa  244  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  41.88 
 
 
762 aa  244  7e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  41.9 
 
 
824 aa  243  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  42.32 
 
 
761 aa  241  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.79 
 
 
761 aa  239  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 
758 aa  235  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  40.41 
 
 
359 aa  233  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  38.81 
 
 
892 aa  233  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  42.52 
 
 
805 aa  233  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  38.82 
 
 
758 aa  230  7e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  40.8 
 
 
788 aa  230  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  39.63 
 
 
758 aa  229  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  41.14 
 
 
760 aa  229  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  40.44 
 
 
785 aa  227  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  42.27 
 
 
798 aa  227  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 
758 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  38.2 
 
 
758 aa  226  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 
758 aa  226  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  39.44 
 
 
810 aa  224  4e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  39.63 
 
 
769 aa  224  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  39.13 
 
 
757 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  39.13 
 
 
809 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  38.55 
 
 
764 aa  222  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.38 
 
 
852 aa  220  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  40.75 
 
 
785 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  41.25 
 
 
780 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 
762 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  40.58 
 
 
364 aa  217  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  38.55 
 
 
799 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  40.88 
 
 
790 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  38.89 
 
 
779 aa  214  5.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  38.42 
 
 
793 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  40.88 
 
 
793 aa  213  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  25.78 
 
 
791 aa  211  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  38.89 
 
 
809 aa  210  7e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  38.82 
 
 
794 aa  207  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.06 
 
 
302 aa  207  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  38.82 
 
 
382 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  39.36 
 
 
812 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.85 
 
 
797 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 
789 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  38.08 
 
 
798 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  38.08 
 
 
798 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  38.08 
 
 
798 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  35.28 
 
 
366 aa  201  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  37.93 
 
 
809 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 
812 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.34 
 
 
810 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
790 aa  198  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 
794 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  38.78 
 
 
803 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  38.98 
 
 
795 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  38.66 
 
 
804 aa  197  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  38.66 
 
 
795 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  40.18 
 
 
790 aa  196  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  38.55 
 
 
800 aa  196  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  36.68 
 
 
821 aa  195  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 
803 aa  195  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>