More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0620 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  51.21 
 
 		 868 aa  953    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  48.34 
 
 		 874 aa  881    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  50.64 
 
 		 868 aa  961    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  50.64 
 
 		 868 aa  957    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  50.87 
 
 		 868 aa  962    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  51.96 
 
 		 869 aa  963    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 842 aa  1675    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  43.79 
 
 		 837 aa  658    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  50.4 
 
 		 868 aa  941    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  50.51 
 
 		 871 aa  892    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  53.36 
 
 		 866 aa  971    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  49.83 
 
 		 868 aa  936    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  50.64 
 
 		 868 aa  957    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  55.09 
 
 		 870 aa  946    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  63.54 
 
 		 865 aa  1070    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  50.98 
 
 		 868 aa  951    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  51.15 
 
 		 869 aa  957    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  38.57 
 
 		 890 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.78 
 
 		 887 aa  541  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  35.14 
 
 		 891 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.93 
 
 		 873 aa  426  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  39.05 
 
 		 867 aa  419  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.76 
 
 		 887 aa  412  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.04 
 
 		 950 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  34.89 
 
 		 826 aa  358  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  35.21 
 
 		 886 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0174  phosphoenolpyruvate synthase  50.31 
 
 		 341 aa  331  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466875  normal  0.4987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.05 
 
 		 821 aa  331  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.61 
 
 		 840 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.42 
 
 		 884 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.66 
 
 		 835 aa  254  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  27 
 
 		 825 aa  253  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.47 
 
 		 903 aa  251  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.94 
 
 		 889 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  41.46 
 
 		 907 aa  243  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  40.24 
 
 		 906 aa  240  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  39.37 
 
 		 971 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  38.91 
 
 		 782 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.4 
 
 		 869 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  38.99 
 
 		 769 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  41.77 
 
 		 799 aa  204  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  41.4 
 
 		 780 aa  204  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 		 762 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  27.51 
 
 		 842 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 		 785 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  27.51 
 
 		 842 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 781 aa  198  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 		 758 aa  198  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  37.77 
 
 		 758 aa  198  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  38.68 
 
 		 754 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 		 758 aa  197  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  37.26 
 
 		 761 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 		 810 aa  195  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.74 
 
 		 811 aa  195  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  41.01 
 
 		 788 aa  194  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  37.15 
 
 		 758 aa  194  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  39.02 
 
 		 809 aa  193  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  35.87 
 
 		 764 aa  192  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.06 
 
 		 891 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  37.26 
 
 		 762 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  38.34 
 
 		 824 aa  192  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  31.7 
 
 		 758 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  36.08 
 
 		 758 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  35.24 
 
 		 758 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  36.06 
 
 		 779 aa  191  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.74 
 
 		 975 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.4 
 
 		 852 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  35.6 
 
 		 757 aa  190  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  41.01 
 
 		 760 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  41.08 
 
 		 785 aa  189  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  36.62 
 
 		 794 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.66 
 
 		 302 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.03 
 
 		 810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 		 796 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  40.13 
 
 		 796 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.85 
 
 		 902 aa  185  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  38.68 
 
 		 796 aa  184  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 760 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 		 892 aa  182  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  35.93 
 
 		 805 aa  181  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  39.94 
 
 		 797 aa  181  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 		 812 aa  181  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  37.83 
 
 		 1115 aa  180  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 821 aa  179  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.41 
 
 		 971 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  40.12 
 
 		 786 aa  178  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 789 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 789 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  37.54 
 
 		 789 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  36.19 
 
 		 761 aa  177  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  37.24 
 
 		 789 aa  177  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.41 
 
 		 971 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  36.83 
 
 		 789 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 		 791 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  36.83 
 
 		 789 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  37.39 
 
 		 809 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  36.83 
 
 		 789 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  36.83 
 
 		 789 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.8 
 
 		 963 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>