77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0174 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0174  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
341 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466875  normal  0.4987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  68.01 
 
 
868 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  67.08 
 
 
868 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  66.46 
 
 
868 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  67.39 
 
 
868 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  65.84 
 
 
868 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  66.46 
 
 
868 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  66.46 
 
 
868 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  65.53 
 
 
868 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  65.84 
 
 
869 aa  431  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  65.84 
 
 
869 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  58.75 
 
 
871 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  57.45 
 
 
870 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  58.7 
 
 
866 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  59.19 
 
 
865 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  50.31 
 
 
874 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  50.31 
 
 
842 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  39.32 
 
 
837 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  34.47 
 
 
890 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.95 
 
 
887 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  29.49 
 
 
891 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.18 
 
 
887 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.78 
 
 
903 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  32.86 
 
 
826 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.15 
 
 
873 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  35.34 
 
 
907 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.18 
 
 
867 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.88 
 
 
950 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  23.89 
 
 
906 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.64 
 
 
821 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  22.63 
 
 
971 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  53.85 
 
 
760 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  32.39 
 
 
886 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.52 
 
 
811 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.04 
 
 
840 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.25 
 
 
869 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  48.57 
 
 
799 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.67 
 
 
835 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  48.57 
 
 
785 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  38.03 
 
 
892 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.15 
 
 
810 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  61.76 
 
 
764 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  63.33 
 
 
762 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.84 
 
 
902 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  26.72 
 
 
758 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  55.88 
 
 
761 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.45 
 
 
891 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  43.59 
 
 
788 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  45.71 
 
 
780 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  58.82 
 
 
761 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  50 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  40.43 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  47.5 
 
 
758 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  42.5 
 
 
757 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  57.5 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  46.15 
 
 
758 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  51.16 
 
 
797 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  46.15 
 
 
758 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  46.94 
 
 
765 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  46.15 
 
 
758 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  55.88 
 
 
782 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  37.7 
 
 
825 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  62.86 
 
 
1097 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  52.63 
 
 
885 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  55.88 
 
 
885 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 
414 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  50 
 
 
781 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  28.79 
 
 
762 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  54.84 
 
 
754 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  53.85 
 
 
692 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  45 
 
 
758 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  50 
 
 
871 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  42.86 
 
 
785 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  48.57 
 
 
769 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  45 
 
 
758 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  46.15 
 
 
868 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44.74 
 
 
852 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>